Ingénieur MEDITWIN en modélisation et couplage de simulateurs 0D/3D

Ingénieur MEDITWIN en modélisation et couplage de simulateurs 0D/3D

Niveau de diplôme exigé : Bac + 5 ou équivalent

Fonction : Ingénieur scientifique contractuel

Niveau d'expérience souhaité : De 3 à 5 ans

A propos du centre ou de la direction fonctionnelle

Le centre de recherche Inria de Saclay a été créé en 2008. Sa dynamique s’inscrit dans le développement du plateau de Saclay, en partenariat étroit d’une part avec le pôle de l’Université Paris-Saclay et d’autre part avec le pôle de l’Institut Polytechnique de Paris . Afin de construire une politique de site ambitieuse, le centre Inria de Saclaya signé en 2021 des accords stratégiques avec ces deux partenaires territoriaux privilégiés.

Le centre compte 39 équipes-projets , dont 27 sont communes avec l’Université Paris-Saclay ou l’Institut Polytechnique de Paris. Son action mobilise plus de 600 personnes , scientifiques et personnels d’appui à la recherche et à l’innovation, issues de 54 nationalités.

Le centre Inria Saclay - Île-de-France est un acteur essentiel de la recherche en sciences du numérique sur le plateau de Saclay. Il porte les valeurs et les projets qui font l’originalité d’Inria dans le paysage de la recherche : l’excellence scientifique, le transfert technologique, les partenariats pluridisciplinaires avec des établissements aux compétences complémentaires aux nôtres, afin de maximiser l’impact scientifique, économique et sociétal d’Inria.

Contexte et atouts du poste

Le projet MEDITWIN est un projet collaboratif en santé numérique, fruit d’une coopération entre trois acteurs majeurs : Dassault Systèmes, IHU France et Inria. L’objectif est de révolutionner les pratiques médicales, par le biais du développement de jumeaux numériques personnalisés des organes, du métabolisme, de tumeurs cancéreuses pour mieux comprendre, mieux diagnostiquer et mieux soigner.10 équipes de recherche Inria, réparties en 5 centres, sont impliquées dans le projet.

Parmi ces 10 équipes, l'équipe SIMBIOTX apporte à MEDITWIN des modèles mathématiques de la circulation sanguine. En particulier, certains modèles requièrent l’utilisation couplée de modèles simples, rapides, applicables à “grande” échelle spatiale (corps humain entier), et de modèles très précis et complexes, mais lents, à “petite” échelle (coeur, zoom sur gros vaisseaux). Ces deux types de modèles sont basés sur des logiciels différents.

Ce poste vise à construire, dans un premier temps, un mécanisme de couplage générique entre ces deux types de modèles, puis d'étendre ce mécanisme à d'autres types de modèles utilisés dans le projet MEDITWIN.

Le poste est ouvert au centre Inria de Saclay. Le(la) recruté(e) intégrera le Service Expérimentation et Développement (SED). L’affectaction porte sur une durée de 12 mois renouvelables.

Mission confiée

L’équipe-projet SIMBIOTX est impliquée dans le projet MEDITWIN sur la thématique Cardiopédiatrie et développe des modèles couplés 0D-3D.

Le(la) recruté(e) aura pour mission de construire un mécanisme d’intéropérabilité générique entre les différentes parties de ces modèles couplés, réalisées chacune avec leur propre logiciel indépendant.La première application pratique sera le couplage d’un modèle 0D (utilisant LumpedFlux, développé par SIMBIOTX) avec un modèle 3D (utilisant FELiScE, également développé à l’Inria mais par une autre équipe-projet COMMEDIA) dans le cadre de MEDITWIN.

A terme, cette bibliothèque de couplage a vocation à être utilisée plus largement, et devra autant que possible être agnostique aux “types” de modèles couplés, méthodes numériques, et au matériel (par exemple, GPU).Des bibliothèques open source spécialisées existent, mais sont insuffisamment génériques, trop spécialisées sur les aspects mathématiques ou physiques, ou d’usage trop difficile pour être utilisées quotidiennement par des équipes de recherche sans ingénieurs logiciel dédiés.

Au-delà de ces missions principales, l’ingénieur sera amené à collaborer avec les acteurs du projet MEDITWIN.

• Revue de l’état de l’art des bibliothèques de couplage spécialisées en modélisation physique;
• Construire le cahier des charges, en collaboration avec les chercheurs et ingénieurs impliqués dans le projet, d’une bibliothèque dédiée à l’interopérabilité des logiciels de modélisation en hémodynamique, suffisamment générique pour être intégrée à plusieurs des logiciels existants;
• Conception, documentation et implémentation d’une première version de cette bibliothèque;
• Intégrer cette bibliothèque à LumpedFlux (hémodynamique 0D) et FELiScE(3D), deux logiciels développés à l’INRIA, de manière à permettre la création des modèles couplés nécessaires pour MEDITWIN; voire d’autres codes selon l’avancement des travaux.

Compétences

• Connaissances solides et expérience en développement logiciel;
• Expérience avec des technologies d’intéropérabilité courantes, telles que:
  • Protocoles de messagerie (eg protobuf), RPC;
  • Middlewares (eg Apache Kafka);
  • Librairies d’intéropérabilité génériques (eg Kafka Connect).
• Bon niveau technique en C++ (la plupart de nos logiciels utilisés en hémodynamique sont écrits en C++), connaissance minimum de Python;
• Compréhension des problématiques de maintenabilité sur le long terme et bonne connaissance des techniques de test logiciel;
• Un intérêt pour les mathématiques appliquées ou la modélisation mécaniste sera un plus;
• Anglais technique courant.
• Travail d’équipe, en particulier dans un contexte interdisciplinaire (chercheurs, professionnels de santé);
• Qualité de synthèse et rédactionnelles (documentation fonctionnelle et technique);
• Une expérience en tant que contributeur/trice sur des projets open source sera un plus.
• Restauration subventionnée
• Transports publics remboursés partiellement
• Congés: 7 semaines de congés annuels + 10 jours de RTT (base temps plein) + possibilité d'autorisations d'absence exceptionnelle (ex : enfants malades, déménagement)
• Possibilité de télétravail (après 6 mois d'ancienneté) et aménagement du temps de travail
• Équipements professionnels à disposition (visioconférence, prêts de matériels informatiques, etc.)
• Prestations sociales, culturelles et sportives (Association de gestion des œuvres sociales d'Inria)
• Date de prise de fonction souhaitée :
• Durée de contrat : 12 mois
• Date limite pour postuler :

Attention : Les candidatures doivent être déposées en ligne sur le site Inria. Le traitement des candidatures adressées par d'autres canaux n'est pas garanti.

Consignes pour postuler

Sécurité défense : Ce poste est susceptible d’être affecté dans une zone à régime restrictif (ZRR), telle que définie dans le décret n° relatif à la protection du potentiel scientifique et technique de la nation (PPST). L’autorisation d’accès à une zone est délivrée par le chef d’établissement, après avis ministériel favorable, tel que défini dans l’arrêté du 03 juillet 2012, relatif à la PPST. Un avis ministériel défavorable pour un poste affecté dans une ZRR aurait pour conséquence l’annulation du recrutement.

Politique de recrutement : Dans le cadre de sa politique diversité, tous les postes Inria sont accessibles aux personnes en situation de handicap.

Inria est l’institut national de recherche dédié aux sciences et technologies du numérique. Il emploie 2600 personnes. Ses 215 équipes-projets agiles, en général communes avec des partenaires académiques, impliquent plus de 3900 scientifiques pour relever les défis du numérique, souvent à l’interface d’autres disciplines. L’institut fait appel à de nombreux talents dans plus d’une quarantaine de métiers différents. 900 personnels d’appui à la recherche et à l’innovation contribuent à faire émerger et grandir des projets scientifiques ou entrepreneuriaux qui impactent le monde. Inria travaille avec de nombreuses entreprises et a accompagné la création de plus de 200 start-up. L'institut s'efforce ainsi de répondre aux enjeux de la transformation numérique de la science, de la société et de l'économie.