Ingénieur en génomique fonctionnelle des plantes H/F
Description du Poste Les Missions Vous assurerez le support technique en génomique au sein d'une équipe de recherche et en serez le ou la référent(e). Par ailleurs, vous piloterez les activités expérimentales de l'atelier de génomique de l'unité. Vous aurez pour mission de mettre en œuvre des techniques variées de génomique fonctionnelle et de génétique moléculaire pour comprendre les mécanismes de régulation de l'expression des gènes et des génomes en lien avec les variations de l'environnement et le changement climatique chez les plantes, en utilisant Arabidopsis thaliana comme modèle principal. L'Activité Approches expérimentales :
- Analyser, à partir d'échantillons de plantes, l'expression des gènes et du génome.
- Préparer des librairies de séquençage RNA-seq (séquençage de l'ARN), suivre le séquençage en lien avec des prestataires de séquençage publics/privés, et interpréter avec les chercheurs l'analyse réalisée par les bio informaticiens.
- Mener à bien des approches de single-nucleus RNA-seq (séquençage de l'ARN à l'échelle de la cellule unique), suivre le séquençage en lien avec des prestataires publics/privés, et l'interpréter comme indiqué ci-dessus.
- Réaliser des approches de RT-q
PCR (en amont ou en validation des approches globales). Etudier les systèmes de régulation de l'expression des gènes ou du génome de plantes. - Préparer des librairies de Ch
IP-seq, ATAC-seq, CUT&TAG, suivre le séquençage en lien avec des prestataires de séquençage publics/privés, et l'interpréter comme indiqué ci-dessus. - Mener à bien des approches de single-nucleus ATAC-seq (analyse de l'état chromatinien à l'échelle de la cellule unique), suivre le séquençage en lien avec des prestataires publics/privés, et l'interpréter comme indiqué ci-dessus