INGENIEUR.E EN BIOINFORMATIQUE F/H

L'hôpital Saint-Louis et son Institut Hospitalo-Universitaire THEMA « Centre National de Médecine de Précision sur les Leucémies » est le premier centre européen pour les hémopathies malignes (https://www.institut-leucemie.fr/). Le laboratoire d'Hématologie de l'hôpital Saint-Louis occupe une place centrale dans le diagnostic et le suivi des patients, ainsi que dans la recherche clinique et translationnelle sur les maladies du sang. Le laboratoire d'hématologie est à l'interface entre le soin et la recherche. En effet, les analyses cellulaires et moléculaires permettant de caractériser les leucémies et les syndromes pré-leucémiques, de rechercher des prédispositions génétiques à ces maladies et d'évaluer la réponse au traitement. De plus, le laboratoire continue de développer des approches innovantes d'analyse génomique et mener des travaux de recherche translationnels sur des échantillons de patients afin de progresser dans la compréhension et le traitement de ces maladies Contribuer aux activités de soin et de recherche translationnelle du laboratoire en participant à l'archivage des données brutes générées par les différents secteurs, au développement de pipeline d'analyse et à la structuration des résultats dans des bases de données interopérables pour les biologistes du laboratoire d'hématologie et la recherche. Missions détaillées :

• Participer à l'archivage des données générées par le laboratoire (par exemple : données de cytométrie en flux, données de séquençage).
• Développer et maintenir des pipelines d'analyse de données générées par le laboratoire (par exemple : données de séquençage capture, données de RNA-seq) et travailler en collaboration avec la plateforme de bio-informatique de l'APHP MOABI.
• Former les ingénieur.es et technicien.nes du laboratoire au lancement de ces analyses.
• Rédiger des protocoles d'utilisation des outils développés et de la gestion ...