Ingénieur(e) d'étude en bioinformatique (H/F)

Cette offre est ouverte aux personnes disposant d’un titre leur reconnaissant la qualité de travailleur handicapé ou travailleuse handicapée.

L'unité

Laboratoire d'océanographie microbienne

Durée du contrat

12 mois

Rémunération

Entre 2496 et 3817, 32 € brut /mois selon expérience.

Date limite de candidature : lundi 8 juin :59

Description du Poste

Nous recrutons un ingénieur (H/F) en bioinformatique. Ce projet concerne la caractérisation du Pan Génome de la microalgue phytoplanctonique Bathycoccus prasinos pour identifier dans l'océan, la structure des populations et les mécanismes d’adaptation à l’échelle spatio-temporelle.

L'Activité

L’activité principale consistera à assembler des données de séquençage issues de la technologie Oxford Nanopore d'une collection d’environ 150 génomes, puis à les intégrer dans des outils d’analyse et de visualisation du Pan génome.

Une seconde mission portera sur l’identification de marqueurs d’insertion/délétion (ins/del) propres aux différentes populations, suivie de leur cartographie sur des jeux de données de métagénomique et de métatranscriptomique environnementales de l'océan mondial.

Votre Profil

Compétences

• Formation : Master en bioinformatique ou diplôme équivalent.
• Solides compétences en bioinformatique et en programmation (notamment en Python). Expérience en assemblage et analyse de génomes, ainsi qu’en construction et analyse de Pan génomes, appréciée.
• Qualités telles que la capacité d’adaptation, le sens du travail en équipe, la rigueur et l’autonomie sont essentielles.
• Maîtrise de l’anglais scientifique indispensable pour la rédaction de rapports et les communications orales.

Votre Environnement de Travail

Le poste est à pourvoir au Laboratoire d’Océanographie Microbienne (LOMIC), situé à Banyuls-sur-Mer. L’activité se déroulera également au laboratoire DIADE situé à Montpellier, dans le cadre d’une collaboration menée via un projet financé par l’Agence Nationale de la Recherche.

Contraintes et risques

aucune

Congés et RTT annuels

44 jours

Pratique et Indemnisation du TT

Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€