Ingénieur(e) d'étude en bioinformatique (H/F)

Description du Poste Les Missions Nous recrutons un ingénieur (H/F) en bioinformatique. Ce projet concerne la caractérisation du Pan Génome de la microalgue phytoplanctonique Bathycoccus prasinos pour identifier dans l'océan, la structure des populations et les mécanismes d’adaptation à l’échelle spatio-temporelle. L'Activité L’activité principale consistera à assembler des données de séquençage issues de la technologie Oxford Nanopore d'une collection d’environ 150 génomes, puis à les intégrer dans des outils d’analyse et de visualisation du Pan génome.

Une seconde mission portera sur l’identification de marqueurs d’insertion/délétion (ins/del) propres aux différentes populations, suivie de leur cartographie sur des jeux de données de métagénomique et de métatranscriptomique environnementales de l'océan mondial. Votre Profil Compétences Formation : Master en bioinformatique ou diplôme équivalent.

Le/La candidat(e) devra posséder de solides compétences en bioinformatique et en programmation (notamment en Python). Une expérience en assemblage et analyse de génomes, ainsi qu’en construction et analyse de Pan génomes, serait fortement appréciée.

Des qualités telles que la capacité d’adaptation, le sens du travail en équipe, la rigueur et l’autonomie sont également essentielles. La maîtrise de l’anglais scientifique est indispensable, tant pour la rédaction de rapports que pour les communications orales. Votre Environnement de Travail Le poste est à pourvoir au Laboratoire d’Océanographie Microbienne (LOMIC), situé à Banyuls-sur-Mer. L’activité se déroulera également au laboratoire DIADE situé à Montpellier, dans le cadre d’une collaboration menée via un projet financé par l’Agence Nationale de la Recherche.

Le LOMIC est reconnu comme un acteur majeur dans l’étude de la biologie et de l’écologie du picophytoplancton eucaryote. Le laboratoire DIADE, quant à lui, est pionnier dans le domaine des analyses pangénomiques et met à disposition des infrastruc...