Ingénieur d’étude en bio-informatique

Overview

CDD·IE·12 mois(renouvelable) Bac+3 / Licence INSERM UMR1342, Institut de Recherche Saint-Louis et Institut de la Leucémie Paris Saint-Louis · Paris 10 (France) Selon grille INSERM

Ingénieur d’étude en bio-informatique

Emploi-type

Ingénieur d’étude

Domaines et cadre

BAP A – Sciences du Vivant

Missions

L’agent participera activement à la gestion et l’analyse bio-informatique des données de séquençage bulk et en cellule unique du projet DYNHAEMICS, sous la supervision de Matthieu Duchmann, au sein de l’unité INSERM UMR1342. Ce projet, coordonné sur le plan scientifique par le Pr Hugues de Thé et sur le plan médical par le Pr Raphaël Itzykson a pour but de comprendre les mécanismes moléculaires impliqués dans la réponse et la résistance des leucémies aiguës myéloïdes à la chimiothérapie.

Activités principales

• Participer à la réception et l’archivage des données de séquençage.
• Interroger des pipelines déjà établis pour l’analyse de données générées au sein du laboratoire (étude du transcriptome et de génotype en bulk et en cellules uniques).
• Paramétrer des outils, logiciels, systèmes pertinents pour les analyses susmentionnées.
• Rédiger des protocoles d’utilisation des outils et des méthodes mises en place/utilisées.
• Veiller au respect des principes d’accessibilité, d’interopérabilité et de portabilité des données et des outils.

Activités associées

• Interagir et apporter un soutien technique à l’ensemble de l’équipe pour les différents projets.
• Adapter les applications informatiques aux besoins du projet.

Connaissances

• Avoir des connaissances approfondies, théoriques et pratiques, en analyses courantes destinées à implémenter les différents pipelines d’analyse bio-informatique.
• Anglais : C1 préféré, B2 minimum.

Savoir-faire

• Bonne maîtrise des langages de programmation R, Python et Bash
• Maitrise de création d’algorithmes
• Connaissance des systèmes d’exploitation Linux et de la compilation de logiciels
• Maitrise de la biologie
• Maitrise de l’anglais scientifique et technique

Aptitudes

• Apprécier le travail en équipe et posséder de bonnes qualités relationnelles.
• Motivation, dynamisme.
• Etre rigoureux dans son travail et avoir le sens de l’organisation.
• Aimer travailler en collectivité

Expérience souhaitée

• Expérience de stage de bio-informatique en laboratoire de biologie
• Expérience en génomique single-cell préférée.

Diplôme(s) souhaité(s)

• Minimum équivalent BTS ou IUT en biologie/bio-informatique.

Structure d’accueil

Code unité : INSERM UMR1342, Institut de Recherche Saint-Louis et Institut de la Leucémie Paris Saint-Louis

Intitulé : Institut de recherche Saint-Louis

Responsable Directeur : Jean Soulier

Chef d’équipe : Hugues de Thé

Adresse : 16, rue de la grange aux belles – 75010 PARIS

Délégation Régionale : DELEGATION REGIONALE PARIS-IDF CENTRE NORD

Contrat

• Type : CDD
• Durée : 1 an (renouvelable une fois)
• Rémunération : Selon grille INSERM
• Date souhaitée de prise de fonctions : Aussitôt que possible

Pour postuler

Merci d’envoyer votre CV (comportant au moins une personne référente à contacter si nécessaire) et lettre de motivation à : Matthieu DUCHMANN -

Procédure

Merci d’envoyer votre CV (comportant au moins une personne référente à contacter si nécessaire) et lettre de motivation

Matthieu DUCHMANN

Publication

Offre publiée le 4 mai 2026, affichage jusqu\u2019au 3 juillet 2026