Ingénieur de Recherche en oncologie pédiatrique (F/H)
L’équipe Recherche Translationnelle en Oncologie Pédiatrique (Dr Schleiermacher) au sein de l’unité U1330 INSERM (CONCERT, direction: Olivier Ayrault), développe des approches innovantes d’analyse de biomarqueurs issus de prélèvements périphériques (ADN libre circulant, ARN, protéines). Ces travaux s’appuient sur de larges cohortes de patients atteints de cancers pédiatriques à haut risque afin de mieux comprendre les mécanismes d’oncogenèse, de résistance aux traitements et de dissémination métastatique.
Nous recrutons un(e) Ingénieur(e) de Recherche pour un poste à forte dominante expérimentale avec une contribution aux analyses ciblées des données de séquençage en lien avec les bio-informaticiens de l’équipe.
Le/la candidat(e) participera au développement de nouvelles technologies basées sur l’analyse des prélèvements périphériques (sang, moelle osseuse, LCR) pour l’étude de l’ADN libre circulant ou d’autres biomolécules. Le poste s’inscrit dans un environnement pluridisciplinaire intégrant séquençage haut débit, biologie moléculaire et cellulaire ainsi que des outils diagnostiques innovants.
Le poste implique une activité régulière de production de librairies NGS et d’analyses de routine des données de séquençage.
Missions principales
- Préparation de librairies NGS (ADN/ARN) à partir de prélèvements périphériques (sang, moelle, LCR), incluant l’ADN libre circulant (cfDNA).
- Développement, mise en œuvre et optimisation de méthodes d’analyse de biomolécules et de détection d’altérations génétiques basées sur le séquençage NGS (WES/WGS, RNA-seq).
- Transfert, validation et application des méthodes sur des cohortes de patients pédiatriques.
- Production et gestion de séries d’échantillons (batch) avec une traçabilité rigoureuse.
- Collaboration étroite avec la plateforme de séquençage (ICGex) et les bio-informaticiens pour le suivi et l’interprétation des données.
- Contribution à la synthèse et présentation des résultats.
- Contribution à l’amélioration continue des protocoles et des performances analytiques.