Doctorant en Biologie des systèmes computationnelle / Bio-informatique (H/F)

Cette offre est ouverte aux personnes disposant d’un titre leur reconnaissant la qualité de travailleur handicapé ou travailleuse handicapée.

L'offre en un coup d'oeil

L'unité

Unité de biologie moléculaire, cellulaire et du développement

Durée du contrat

36 mois

Rémunération

La rémunération est d'un minimum de 2300,00 € mensuel

Description du Poste

Sujet De Thèse

Le projet DigiTREAT est financé dans le cadre du programme PEPR Santé numérique (France 2030 – ANR) afin de développer le premier jumeau numérique médical multi-échelle dédié à la polyarthrite rhumatoïde (RA-DT). Le projet est coordonné par le professeur Anna Niarakis au Centre de Biologie.

Le/La doctorant(e) travaillera sur la construction et le calibrage d'un modèle générique multi-échelle intégrant des données omiques accessibles au public. Pour cela, il/elle devra :

• Analyser et intégrer des ensembles de données omiques issues de cellules individuelles et de populations.
• Développer des modèles computationnels prédictifs.
• Étalonner et valider des modèles computationnels à l'aide de données expérimentales.
• Améliorer des performances prédictives et de la précision biologique.
• Contribuer à la découverte de biomarqueurs.

La personne recrutée devra être titulaire d'un Master Bio-Informatique, Biologie Computationnelle ou dans un domaine connexe. Le projet requiert une expérience avec les données omiques (scRNA-seq et/ou bulk), des compétences en programmation : R, Python (la maîtrise de C++ est un atout), de solides compétences analytiques et interdisciplinaires, ainsi que la maîtrise de l'anglais.

Votre Environnement de Travail

Le projet DigiTREAT, financé par le programme PEPR Digital Health, vise à développer un jumeau numérique multi-échelle pour la polyarthrite rhumatoïde (PR) en intégrant la modélisation computationnelle, les données omiques et les cohortes cliniques. Le projet répond à un besoin clinique majeur non satisfait : prédire la réponse au traitement dans les maladies auto-immunes complexes.

Le poste est basé au Centre de Biologie Intégrative (CBI) de Toulouse, un centre de recherche commun au CNRS et à l'Université Toulouse III – Paul Sabatier dédié à la biologie intégrative à toutes les échelles. Le candidat rejoindra la division de biologie des systèmes et sera supervisé par le professeur Anna Niarakis.

Le poste se situe dans un secteur relevant de la protection du potentiel scientifique et technique (PPST), et nécessite donc, conformément à la réglementation, que votre arrivée soit autorisée par l'autorité compétente du MESR.

Rémunération et avantages

Rémunération

La rémunération est d'un minimum de 2300,00 € mensuel

Congés et RTT annuels

44 jours

Pratique et Indemnisation du TT

Pratique et indemnisation du TT

Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€