Bioinformaticien(ne) (H/F) en pour le CNR Hépatites Virales

Bioinformaticien(ne) (H/F) en pour le CNR Hépatites Virales

CDD·Ingénieur autre·12 mois(renouvelable)Bac+5 / MasterPlateforme GenoBioMICS, Hôpital Henri Mondor - APHP·Créteil (France)

Dans le cadre du renforcement de notre plateforme de séquençage à haut débit (NGS) nous recrutons un(e) Ingénieur(e) en Bioinformatique dédié(e) à ce CNR.

Vos missions seront :

• Développer et optimiser les pipelines d’analyse pour le génotypage et la détection de mutations de résistance
• Analyser la diversité intra-hôte (quasi-espèces) à partir de données de séquençage profond
• Développement d’Outils Spécifiques, notamment pour l’automatisation des analyses phylogénétiques et de rendu des résultats
• Benchmarking de nouvelles solutions de séquençage (Nanopore pour les génomes complets, séquençage de molécules uniques)
• Structurer et maintenir la base de données du CNR

Le laboratoire est engagé dans une démarche de haute qualité et est accrédité selon la norme ISO 15189. Vous devrez donc assurer la traçabilité complète des analyses, la gestion des versions des outils (via conteneurs) et la rédaction de la documentation technique nécessaire au maintien de l’accréditation pour le diagnostic viral.