Thèse Valorisation des déchets agro-industriels pour la production de biosurfactants destinés a[...]

Présentation INRAE : l’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche réunissant une communauté de travail de 12 000 personnes, 272 unités de recherche et service implantées dans 18 centres en France. Il est reconnu comme l’un des leaders mondiaux en sciences agricoles, alimentaires, végétales et animales, développant des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources.

Contexte

L’hygiène des surfaces dans les industries agroalimentaires est un enjeu majeur pour garantir la sécurité sanitaire des aliments et limiter la persistance des biofilms microbiens sur les équipements. Ces biofilms représentent des réservoirs de microorganismes pathogènes difficiles à éliminer par les stratégies de nettoyage conventionnelles. Face aux limites des tensioactifs pétrochimiques, la recherche porte sur des molécules biosourcées, efficaces et plus respectueuses de l’environnement, notamment les rhamnolipides, biosurfactants glycolipidiques aux propriétés tensioactives, antimicrobiennes et antibiofilms. Leur production, naturellement réalisée par certaines bactéries telles que Pseudomonas aeruginosa, est limitée par le caractère opportuniste de cet agent.

Démarche scientifique et objectifs de la thèse

La thèse vise à utiliser Pseudomonas aeruginosa comme modèle d’étude pour mieux comprendre et piloter la biosynthèse des rhamnolipides, puis transférer ces connaissances vers des modèles non pathogènes, compatibles avec une production sûre et durable. Elle mobilise des approches complémentaires en microbiologie, biologie moléculaire et ingénierie des bioprocédés. Dans une logique d’économie circulaire, la valorisation de coproduits agricoles comme substrats fermentaires sera intégrée afin de réduire la dépendance aux matières premières raffinées.

Au-delà de la production microbienne, le projet inclut la réflexion sur les étapes de récupération et de purification des rhamnolipides, en privilégiant des procédés sobres et sans solvant. Les rhamnolipides obtenus seront caractérisés pour leurs activités tensioactives, antimicrobiennes et antibiofilms, afin d’orienter leur intégration dans des formulations biosourcées destinées au nettoyage durable et au contrôle des biofilms.

L’objectif global de la thèse est de développer une approche intégrée reliant :

• la maîtrise des procédés de production de rhamnolipides à partir de Pseudomonas aeruginosa, puis leur adaptation à des modèles microbiens non pathogènes compatibles avec une production sûre et durable ;
• la valorisation de coproduits agricoles comme substrats fermentaires ;
• l’évolution vers des procédés de récupération plus sobres ;
• l’évaluation des propriétés fonctionnelles des rhamnolipides produits pour des applications en hygiène des surfaces.

Formations et compétences recherchées

Le candidat doit être titulaire, ou en cours d’obtention, d’un Master 2 ou d’un diplôme d’ingénieur en microbiologie, biotechnologies, génie des procédés, agroalimentaire ou domaine connexe. Des compétences en culture microbienne et fermentation liquide sont indispensables, ainsi que des connaissances en chimie analytique, extraction de biomolécules, biologie moléculaire ou physicochimie. Un intérêt pour le développement durable et l’économie circulaire est requis.

Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez d’un ensemble d’avantages :

• jusqu’à 30 jours de congés + 15 RTT par an (temps plein)
• un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs
• des dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle
• un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux
• des prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel
• des activités sportives et culturelles
• une restauration collective

Égalité et neutralité

Les personnes accueillies à INRAE, établissement public de recherche, sont soumises aux dispositions du Code de la fonction publique notamment en ce qui concerne l’obligation de neutralité et le respect du principe de laïcité. Dans l’exercice de leurs fonctions, qu’elles soient ou non au contact du public, elles ne doivent pas manifester leurs convictions, par leur comportement ou leur tenue, qu’elles soient religieuses, philosophiques ou politiques.