Stage de fin d'étude M2 - Ingénieur Agri/Agro (H/F)

Au sein du Laboratoire de Génétique et Biométrie, le sujet de votre stage est le suivant : Analyse QTL en populations biparentales et GWAS pour la recherche de résistance à divers stress biotiques et abiotiques chez le triticale

Face aux aléas climatiques, le développement de variétés de triticale plus tolérantes aux stress biotiques et abiotiques est de première importance. Le projet FSOV RUSTRIT vise à poursuivre les efforts de recherche sur la compréhension du déterminisme génétique des principales maladies foliaires du triticale que sont les rouilles et l'oïdium, ainsi que la tolérance à la germination sur pied (GSP), facteur très limitant sur cette espèce pouvant affecter l'utilisation de la récolte et dégrader la qualité des lots de semences. Les maladies rouille jaune et oïdium et la GSP, seront analysés à partir d'un panel et/ou de populations biparentales par GWAS et par recherche de QTL.
Durant le stage, qui s'inscrira dans la 3ème année du projet, il s'agira d'effectuer le phénotypage sur site pour la résistance à l'oïdium et pour la GSP puis d'analyser l'ensemble des données de génotypage de 2025 et de phénotypage de 2026 par recherche de QTL et GWAS. Une prise en main du protocole d'analyse sera effectuée sur les données phénotypiques obtenues en 2025.

Les données 2026 à analyser seront les suivantes :

- Rouille Jaune
Phénotypage en 3 sites de la pop BREHAT/RIVOLT de 200 lignées haploïdes doublés

- Oïdium
Phénotypage en 2 sites de la pop TALENTRO/MAXIMAL de 281 lignées haploïdes doublés
Phénotypage en 4 sites dont FD du PANEL de 162 lignées et variétés (notations précocité à épiaison, hauteur, oïdium, autres maladies)

- GSP

Phénotypage en 3 sites dont FD de la pop GRANDVAL/TRIBECA de 203 lignées haploïdes doublés (précocité à épiaison, hauteur, maladies, test de Lerebour pour la résistance à la GSP)
Phénotypage en 3 sites du PANEL

Le stage repose donc sur 3 objectifs :

• Phénotypage oïdium du panel RUSTRIT (et autres maladies si présence), et germination sur pied d'une population biparentale
• Analyser les populations biparentales par recherche de QTL
• Analyser le panel par GWAS
• Localisation : Cappelle-en-Pévèle (Haut-de France (59) - 25 km de Lille)
• Durée : 6 mois (début entre janvier et mars 2026)
• Rémunération minimale légale de stage
• Possibilité d'un logement sur place si sélection rapide

Si le poste vous intéresse, merci de bien vouloir nous envoyer votre CV et votre lettre de motivation à l'adresse mail suivante : avant le 31 octobre 2025

• Actuellement en dernière année d'étude : Ecole d'ingénieur agro/agri ou à l'université en Master 2, vous avez un stage de fin d'étude de 6 mois à effectuer.
• Connaissances : formation en amélioration des plantes et en analyse de données sous R
• Compétences opérationnelles : maîtrise des outils statistiques, informatiques, capacité d'analyse et de synthèse
• Prise d'initiative, curiosité et travail en équipe