Résolution des impasses diagnostiques dans les troubles du neurodéveloppement par une approche [...]

Organisation/Company Université de Tours Research Field Biological sciences "Biology Researcher Profile" Recognised Researcher (R2) Leading Researcher (R4) First Stage Researcher (R1) Established Researcher (R3) Application Deadline 26 Apr 2026 - 22:00 (UTC) Country France Type of Contract Temporary Job Status Full-time Is the job funded through the EU Research Framework Programme? Not funded by a EU programme Is the Job related to staff position within a Research Infrastructure? No

Offer Description

Malgré le développement du séquençage à haut débit, 40 à 60 % des patients présentant un trouble du neurodéveloppement (TND) demeurent sans diagnostic moléculaire après une analyse d'exome ou de génome. Ce projet de thèse propose une approche intégrée visant à lever ces impasses diagnostiques par la combinaison de réanalyses génomiques systématiques, d'analyses transcriptomiques (RNA-Seq) et de validations fonctionnelles. La réanalyse portera sur une cohorte de plus de 300 patients suivis au CHU de Tours, tandis que l'analyse primaire des données de RNA-Seq permettra d'identifier des anomalies d'expression ou d'épissage non détectées par l'analyse génomique seule. Les gènes candidats identifiés seront validés par des études fonctionnelles de neurogénomique avec un focus particulier sur le gène SEMA6D récemment identifié comme un nouveau gène candidat dans les TND.

Despite the widespread implementation of high-throughput sequencing, 40–60% of patients with a neurodevelopmental disorder (NDD) remain without a molecular diagnosis after exome or genome analysis. This PhD project proposes an integrated approach to overcome these diagnostic challenges by combining systematic genomic reanalysis, transcriptomic analyses (RNA-Sequencing), and functional validation studies. The reanalysis of genomes and exomes data will be conducted on a cohort of over 300 patients with negative initial results, followed in the genetics department at the University Hospital of Tours. In parallel, primary RNA-Sequencing analysis will enable the identification of expression or splicing abnormalities which were not detected by genome sequencing. The candidate genes identified through these approaches will be validated through functional neurogenomic studies, with a particular focus on SEMA6D, recently identified as a novel candidate gene in neurodevelopmental disorders.

Début de la thèse : 01/10/2026

Funding category: Financement d'une collectivité locale ou territoriale

Knowledge of bioinformatics—particularly in the analysis and interpretation of high-throughput sequencing data (e.g., exome or RNA-seq), familiarity with human genetics databases, predictive tools, and OMICS approaches—would be considered an asset.

Hands‑on experience with fundamental molecular and cellular biology techniques is required, including DNA/RNA extraction, PCR, sequencing, RT‑PCR, qPCR, cloning, cell culture, transfection, Western blotting, and immunofluorescence.

The candidate should demonstrate strong motivation to pursue a PhD, excellent analytical abilities, strong writing skills in both English and French, effective communication skills, and a high level of scientific and technical rigor.