Postdoc H/F – Reconstruction des épidémies de tordeuse de Bourgeon de l’Epinette au cours de l’[...]
Missions
Missions : La personne recrutée aura la charge de développer un protocole de détection et de quantification de la Tordeuse des Bourgeons de l’Epinette (TBE) au cours de l’Holocène à partir d’analyses d’ADN sédimentaire lacustre (qPCR, DD-PCR). Elle utilisera ces données pour reconstituer la fréquence et/ou l’intensité des épidémies de TBE, pour caractériser les interactions avec les régimes de feux. En fine, elles serviront également dans l’approche combinée paléo-modélisation, au cœur du projet RETROPEST (
Activités / Responsabilités
- Détermination d’un gène cible pour le design d’amorces spécifiques à Choristoneura fumiferana dans l’ADN mitochondrial et/ou nucléaire
- Développement d’un protocole de qPCR et DD-PCR pour la quantification de ce gène cible dans des matrices sédimentaires (objectifs : obtenir des concentrations robustes et reproductibles)
- Application de ce protocole aux enregistrements sédimentaires lacustres du projet. Le candidat bénéficiera de l’appui technique des personnels du laboratoire et pourra également encadrer un ou des étudiants de M2.
- Traitement des concentrations obtenues pour calculer des fréquences d’épidémies
- Comparaison des données obtenues avec les données sur les feux de forêts et les dynamiques de végétation
- Publication de la méthodologie développée, et publication des résultats combinés dans une étude multi-proxies sur les perturbations multiples
Contexte de travail
Ce poste de chercheur post-doctoral s’inscrit dans le cadre du projet ANR RETROPEST « Wildfires & Insect outbreaks in Boreal forests. A combined approach using paleoecology, sedimentary DNA & modelling » (2025‑2029, PI : D. Rius). L’objectif général est de mieux caractériser les interactions entre ces deux régimes de perturbations en réponse au changement climatiques passé, présent et futur et leur impact sur les dynamiques de végétation forestière au Québec. Le projet s’appuie sur un réseau de sites d’études régionaux, composés de carottages courts (≈2000 ans) et longs (≈8000‑9000 ans) sur des quantifications paléoclimatiques, des reconstructions de la végétation et des paléofeux au cours de l’Holocène. La reconstruction des épidémies de TBE sera performée à partir de l’ADN sédimentaire dans les carottes lacustres.
Profil recherché / Compétences
- Doctorat en paléo-écologie, ADN sédimentaire ou ADN environnemental
- Connaissances des protocoles et techniques de biologie moléculaire (PCR, qPCR, etc.)
- Compétences en traitement numérique des données (R/Python etc.)
- Capacité à s’intégrer dans une équipe multidisciplinaire et à participer à des projets collaboratifs