Ingénieure Bioinformaticien H/F

Référent bioinformatique de la plateforme protéomique, vous intervenez sur l'ensemble de la chaîne d'analyse par la manipulation de grands jeux de données et contrôle qualité bioinformatique. Ainsi, vous transformez les données de spectrométrie de masse en résultats fiables et reproductibles pour nos projets R&D et nos clients des secteurs cosmétique et agricole.

Missions

• Traiter et analyser les données protéomiques quantitatives (DIA, DDA)
• Développer, améliorer et assurer la maintenance du pipeline interne (Python, R)
• Réaliser les imports et les conversions et préparer les données issues de Spectronaut, DIA-NN ou Proteome Discoverer
• Filtrer, imputer les valeurs manquantes et contrôler la qualité des jeux de données
• Assurer l'enrichissement fonctionnel (STRING, Mercator) et les analyses statistiques (ANOVA, Tukey via R)
• Générer des matrices quantitatives, de visualisations et de réseaux d'interaction protéique (Cytoscape)
• Calculer les scores de claims et produire des livrables scientifiques à destination de nos clients
• Mettre en place des pipelines reproductibles et de bonnes pratiques de data management
• Rédiger des SOPs et de la documentation Qualité
• Assurer une veille technologique et contribuer à l'évolution de la plateforme analytique