Ingénieur / Ingénieure de recherche scientifique (H/F)

Mission :
L'ingénieur sera chargé de concevoir et mettre en œuvre des pipelines bioinformatiques pour l'étude des gènes suppresseurs de tumeurs situés sur les chromosomes sexuels chez les mammifères.

Activités :
- Concevoir et mettre en œuvre des pipelines bioinformatiques pour l'étude des gènes suppresseurs de tumeurs situés sur les chromosomes sexuels chez les mammifères. Ce travail comprendra l'identification et l'annotation de ces gènes à partir de bases de données de référence (Ensembl, COSMIC, TSGene), ainsi que l'évaluation de leur nombre de copies (CNV) à l'échelle de plusieurs espèces et l'analyse de synténie.

- Analyser les données de couverture génomique afin de détecter d'éventuelles aneuploïdies des chromosomes sexuels, et participera à l'intégration de données phénotypiques (prévalence du cancer selon le sexe) et écologiques (traits d'histoire de vie) issues de bases interspécifiques telles que Species360, AnAge ou PanTHERIA.

- Procéder à des analyses statistiques comparatives

- Mettre en place des modèles permettant d'étudier les liens entre structure des chromosomes sexuels, duplications de gènes suppresseurs et vulnérabilité au cancer. L'ingénieur interagira étroitement avec les autres membres du consortium, en particulier les biologistes évolutifs et les experts en génomique, et assurera une documentation claire et reproductible des analyses..