Ingénieur-es d'étude en bioinformatique (H/F)

Deux postes pour des ingénieur-es d'étude en bioinformatique sont à pourvoir. Les ingénieur-es se verront confier l'analyse bioinformatique de données de génomique et multi-omiques, issues d'un programme de recherche portant sur les rétrotransposons, en collaboration avec les membres de l'équipe « Rétrotransposons et plasticité du génome » à l'IRCAN, Nice (https://www.ircan.org/research/teams/gael-cristofari/).

Activités principales
- Organiser le recueil, stockage et contrôle des données
- Développer, tester et implémenter des pipelines d'analyse bioinformatique
- Effectuer des analyses computationnelles et statistiques en génomique
- Discuter des résultats avec les membres de l'équipe
- Mettre en forme les résultats en vue de publications et assurer la pérennité des outils et résultats à travers des outils de gestion de projet et de documentation adaptés
- Diffuser et valoriser les résultats et réalisations sous forme de rapports, brevets, publications, présentations orales, y compris en Anglais

Activités associées
- Contribuer aux travaux collaboratifs de l'équipe
- Assister les autres membres de l'équipe dans les expériences de biologie computationnelle
- Maintenir les outils et les connaissances du laboratoire en biologie computationnelle (veille technologique et scientifique), notamment à travers la lecture d'articles de recherche.

Connaissances
- Concepts en biologie et génomique
- Statistiques (connaissance approfondie)
- Biologie computationnelle (connaissance approfondie)
- Langue anglaise (B2 minimum)

Savoir-faire
- Maîtrise du travail sous linux en ligne de commande (bash)
- Maîtrise d'au moins un langage de script (par ex. Python, R ou bash)
- Expérience en gestion de projet et documentation (versioning, bug tracking, Markdown, Jupyter Notebook, etc)
- Expérience en bases de données relationnelles (MySQL) et programmation d'applications web serait un plus

Aptitudes
- Rigueur et grande attention pour les détails
- Capacité de raisonnement analytique
- Travail d'équipe
- Autonomie, sens de l'organisation et pédagogie
- Communication scientifique orale et écrite en Anglais