Ingénieur en bioinformatique structurale (H/F)

Offre n° 205MKPK Ingénieur en bioinformatique structurale (H/F)

L'UTC recrute un ingénieur contractuel F/H pour rejoindre le laboratoire Génie Enzymatique et Cellulaire – département génie biologique, dans le cadre d'un projet en collaboration avec le LMAC. Ce recrutement s'inscrit dans le cadre du projet intitulé ORIGAMI « Conception rationnelle d'oligonucléotides simple brin fonctionnels par rempliement inversé pour des applications biotechnologiques », financé par le Programme de Prématuration du Pôle Universitaire d'Innovation de l'Alliance Sorbonne Université.

Mission : La personne recrutée participera à l'activité de recherche sur le développement d'un workflow numérique pour le repliement inverse des oligonucléotides simple brin.

Activités :

• Modélisation moléculaire in silico
• Modélisation stochastique
• Optimisation de protocoles in silico
• Codage
• Recherche bibliographique

Contexte : Les acides nucléiques simple brin (ssNAs), un outil biotechnologique très puissant, sont capables de reconnaître spécifiquement et sélectivement des molécules grâce aux structures 3D qu'ils adoptent. Donc, la conception de ssNAs à visée thérapeutique ou diagnostique nécessite la définition de l'ensemble des séquences de ssNAs qui se replient en une structure cible (repliement inverse). Des outils numériques de repliement inverse existent, mais ils se bornent à fournir peu de résultats, sans les assortir d'une mesure de la qualité de la séquence fournie et se focalisent sur la structure 2D. Nous fournirons une procédure complète et généralisable, accessible via un web serveur, combinant des méthodes numériques et computationnelles et des validations expérimentales pour concevoir des séquences de ssNAs ayant une structure 3D et une fonction souhaitées. La première application visera la conception de ssNAs, brevetables, pour le diagnostic de la maladie de Lyme.

Informations complémentaires :

• Démarrage : 16/03/2026
• Financement : 15/04/2026
• Type de contrat : CDD – 13 mois, jusqu'au 30/09/2027 au plus tard
• Rémunération mensuelle brute : selon expérience et financement
• Volume horaire : 37 heures et 30 minutes par semaine (1 607 heures par an)
• Lieu : L'UTC, laboratoire Génie Enzymatique et Cellulaire (CNRS UMR 7025), en collaboration avec le Laboratoire de Mathématiques Appliquées de Compiègne (LMAC)
• Environnement : Station de travail adaptée pour des travaux de biocinformatique

Prérequis du poste

• Diplôme : Master 2
• Domaine : bioinformatique, mathématiques appliquées
• Compétences : Modélisation stochastique/machine learning; Modélisation moléculaire; Anglais niveau B2 minimum; Programmation (Python)

Profil souhaité

• Expérience débutée acceptée
• Bac+5 et plus ou équivalents
• Secteur d'activité : Enseignement supérieur