Ingénieur en bioinformatique (H/F) pour l’analyse de transcriptomes et traductomes

Ingénieur en bioinformatique (H/F) pour l’analyse de transcriptomes et traductomes

CDD·IR·12 mois(renouvelable) Bac+5 / Master Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC, UMR9198) · Gif sur Yvette (France)

Date de prise de poste : 1 septembre 2026

Descriptif du projet et de l’environnement de travail : Ce travail s’inscrit dans un projet financé par l’INCA qui vise à étudier les régulations traductionnelles par « ribosome profiling » dans différents organismes allant des virus géants jusqu’à l’Homme en passant par les bactéries pathogènes. Cette approche originale permet d’avoir une vision globale de la traduction de tous les ARNm dans la cellule, grâce au séquençage massif des fragments d’ARNm protégés par le ribosome. Le (la) candidat(e) intégrera l’équipe de Génomique, Structure, et Traduction spécialisée dans l’étude des mécanismes de la fidélité de la traduction chez les eucaryotes. Il ou elle sera amené(e) à interagir avec les plateformes de séquençage massif de Gif-sur-Yvette ainsi qu’avec les équipes de bio-informatique de l’I2BC. L’environnement de travail fournit un cadre exceptionnel pour le développement de nouveaux outils bioinformatiques, mais nécessite de bonnes qualités relationnelles.

Descriptif du poste : CDD niveau ingénieur d’étude, éventuellement renouvelable selon la disponibilité des financements. Le poste est à pourvoir dès le mois de septembre 2026 pour une durée minimale d’un an, renouvelable. La rémunération est fonction de l’expérience professionnelle du candidat. L’activité de l’ingénieur(e) se fera sous la direction scientifique du responsable du projet. Il ou elle sera en charge de l’analyse des données de séquençage haut débit générées dans l’équipe (Ribosome profiling, RNAseq) à partir de différentes cellules (cellules humaines saines ou cancéreuses, virus ou bactéries pathogènes). Ce travail sera complété par le développement et la maintenance d’outils informatiques spécifiques à l’analyse du traductome (RiboSeq). Ces outils permettront une analyse qualitative et quantitative des résultats de séquençage afin de regrouper les gènes candidats par familles fonctionnelles.

Pour cela il faudra :

• Analyser la littérature scientifique
• Identifier les réseaux de gènes impliqués dans les différentes conditions expérimentales
• Interroger les banques de données en ligne

Profil recherché :

• Niveau Master 2, ingénieur, avec une première expérience dans le traitement et l’analyse NGS
• Maîtriser les concepts et outils de la bioinformatique
• Maîtriser un ou plusieurs langages de programmation (Bash, R, Python)
• Connaissances en analyses statistiques de données « omiques »
• Des notions de biologie/génomique sont obligatoires
• Des notions FAIR : gestionnaires de version (Git), de pipeline (Snakemake) et de conteneurs (Docker) seraient appréciées

Qualités personnelles :

• Être capable de travailler à l’interface entre les biologistes et les bio-informaticiens
• Avoir un réel intérêt pour les questions biologiques
• Faire preuve d’autonomie, d’initiative et d’une forte motivation
• Être organisé et consciencieux
• Très bonne aptitude relationnelle pour travailler en équipe