Ingénieur-e sur l’implémentation d’indicateurs génétiques

À propos de l'INRAE

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, réparties dans 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi‑performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Environnement de travail et missions

Vous serez accueilli(e) au sein de l’UMR Biogeco, Biodiversité des gènes aux communautés, une unité mixte de recherche sous tutelle d’INRAE et de l’Université de Bordeaux, située sur le site “Domaine de l’Hermitage” à Cestas, France.

Votre contrat est financé par le projet collaboratif Recherche‑Action FR‑IDGE – Cadre mondial de biodiversité et conservation de la diversité génétique en France.

Responsabilités principales

• Co‑construire, en étroite collaboration avec les parties prenantes concernées, une méthodologie de calcul des indicateurs génétiques adaptée aux territoires français d’outre‑mer, avec la Guyane française comme région pilote.
• Mettre en œuvre, évaluer et contribuer à l’amélioration de workflows standardisés et reproductibles pour le calcul des indicateurs génétiques, en s’appuyant sur les recommandations de bonnes pratiques.
• Construire et animer un réseau de parties prenantes autour des indicateurs génétiques, promouvoir leur utilisation comme outils d’aide à la décision, et organiser des ateliers de formation.
• Piloter la consolidation des listes d’espèces et la collecte des données pertinentes – génétiques et/ou proxies non basés sur l’ADN – pour le calcul des indicateurs génétiques, notamment pour les territoires français d’outre‑mer.
• S’engager auprès de la communauté internationale de génétique de la conservation pour promouvoir le projet et renforcer le rôle de la France comme pôle de référence.
• Contribuer à la gestion des données du projet, en assurant leur bonne organisation, leur curation et leur accessibilité.
• Contribuer à la rédaction des rapports, à la publication et à la diffusion des résultats auprès des communautés scientifiques et des acteurs des politiques publiques.

Vous serez amené(e) à voyager occasionnellement, pour les réunions du projet, à l’international, et pour faciliter la coopération avec l’OFB, le Pôle National des Données de Biodiversité et le GBIF.

Formation et compétences recherchées

• Doctorat en génétique évolutive ou en génétique de la conservation, ou équivalent.
• Solide formation en génétique des populations et/ou en génétique de la conservation.
• Maîtrise des outils bioinformatiques pour l'analyse génétique/génomique des populations.
• Bonne maîtrise d’au moins un langage de script (R et/ou Python).
• Connaissance des cadres de surveillance de la biodiversité et des politiques internationales de conservation (ex. CDB, Cadre mondial de Kunming‑Montréal).
• Bonne compréhension des métriques de diversité génétique et de leur pertinence écologique.
• Connaissance des territoires français d’outre‑mer et intérêt pour leur biodiversité.
• Aptitudes démontrées en rédaction scientifique et expérience en publication.
• Bonne maîtrise du français et de l’anglais (niveau B2 minimum).
• Expérience appréciée : analyse de données de génétique/génomique des populations, estimation d’indicateurs génétiques, engagement avec des parties prenantes, environnement Linux, principes FAIR.
• Aptitudes recherchées : communication claire avec les gestionnaires de biodiversité et partenaires scientifiques internationaux, travail en équipe, présentation, autonomie, prise d’initiative, organisation, gestion simultanée de tâches, adaptabilité.

Qualité de vie à INRAE

• jusqu’à 30 jours de congés + 15 RTT par an (en temps plein)
• soutien à la parentalité : CESU, garde d’enfants, prestations de loisirs
• développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle
• accompagnement social : conseil, écoute, aides et prêts sociaux
• vacances et loisirs : chèque‑vacances, hébergements à tarif préférentiel
• activités sportives et culturelles
• restauration collective

Les personnes accueillies à l’INRAE, établissement public de recherche, sont soumises aux dispositions du Code de la fonction publique notamment en ce qui concerne l’obligation de neutralité et le respect du principe de laïcité. Dans l’exercice de leurs fonctions, qu’elles soient ou non au contact du public, elles ne doivent pas manifester leurs convictions, de façon religieuse, philosophique ou politique.

En savoir plus : site fonctionpublique.gouv.fr