Ingénieur-e sur l’implémentation d’indicateurs génétiques

Présentation INRAE

Le Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi‑performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Environnement de travail, missions et activités

Vous serez accueilli(e) au sein de l’UMR Biogeco, Biodiversité des gènes aux communautés, une unité mixte de recherche sous tutelle d’INRAE et de l’Université de Bordeaux, sur le site “Domaine de l’Hermitage” au 69 route d’Arcachon à Cestas, France. Biogeco compte environ 130 membres du personnel, dont 75 permanents, ainsi que de nombreux étudiants, postdocs, collaborateurs et visiteurs. Ses recherches portent principalement sur la biodiversité, son fonctionnement, l’évolution, l’adaptation, la conservation et la restauration des écosystèmes, principalement les forêts, mais aussi d’autres écosystèmes naturels et anthropisés.

Votre contrat est financé par le projet collaboratif Recherche‑Action FR‑IDGE. Le projet facilite la mise en œuvre du Cadre mondial de biodiversité (CMB) de la Convention sur la diversité biologique (CDB) par le calcul d’indicateurs génétiques. Ces indicateurs, adoptés au sein du CMB, visent à mesurer l’avancement en matière de conservation de la diversité génétique.

Responsabilités

• Co‑construire, en étroite collaboration avec les parties prenantes concernées, une méthodologie de calcul des indicateurs génétiques adaptée aux territoires français d’outre‑mer, en utilisant la Guyane française comme région pilote.
• Mettre en œuvre, évaluer et contribuer à l’amélioration de workflows standardisés et reproductibles pour le calcul des indicateurs génétiques, en s’appuyant sur les recommandations de bonnes pratiques.
• Construire et animer un réseau de parties prenantes autour des indicateurs génétiques, promouvoir leur utilisation comme outils d’aide à la décision, et organiser des ateliers de formation.
• Piloter la consolidation des listes d’espèces et la collecte des données pertinentes – génétiques et/ou proxies non basés sur l’ADN – pour le calcul des indicateurs génétiques, avec un accent particulier sur les territoires français d’outre‑mer.
• S’engager auprès de la communauté internationale de génétique de la conservation pour promouvoir le projet et renforcer le rôle de la France comme pôle de référence.
• Contribuer à la gestion des données du projet, en assurant leur bonne organisation, leur curation et leur accessibilité.
• Contribuer à la rédaction des rapports, à la publication et à la diffusion des résultats du projet auprès des communautés scientifiques et des acteurs des politiques publiques.

Voyages occasionnels peuvent être requis, notamment pour les réunions du projet et à l’international, afin de faciliter la coopération avec les partenaires.

Formations et compétences recherchées

• Doctorat en génétique évolutive ou en génétique de la conservation, ou équivalent.
• Solide formation en génétique des populations et/ou en génétique de la conservation.
• Maîtrise des outils bioinformatiques pour l’analyse génétique/génomique des populations.
• Bonne maîtrise d’au moins un langage de script (R et/ou Python).
• Connaissance des cadres de surveillance de la biodiversité et des politiques internationales de conservation (ex. CDB, Cadre mondial de Kunming‑Montréal).
• Bonne compréhension des métriques de diversité génétique et de leur pertinence écologique.
• Connaissance des territoires français d’outre‑mer et intérêt pour leur biodiversité.
• Aptitudes démontrées en rédaction scientifique et expérience en publication.
• Bonne maîtrise du français et de l’anglais (niveau B2 minimum).
• Expérience appréciée en analyse de données de génétique/génomique des populations.
• Expérience en génétique de la conservation et/ou en estimation d’indicateurs génétiques.
• Expérience en engagement avec des parties prenantes.
• Connaissance de l’environnement ligne de commande Linux.
• Connaissance de l’application des principes FAIR.
• Compétences relationnelles et de communication, capacité à travailler de manière autonome et à prendre des initiatives.

Votre qualité de vie à INRAE

• Jusqu’à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein).
• Un soutien à la parentalité : CESU, garde d’enfants, prestations pour les loisirs.
• Dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle.
• Accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux.
• Prestations vacances et loisirs : chèque‑vacances, hébergements à tarif préférentiel.
• Activités sportives et culturelles.
• Restauration collective.

Les personnes accueillies à INRAE, établissement public de recherche, sont soumises aux dispositions du Code de la fonction publique notamment en ce qui concerne l’obligation de neutralité et le respect du principe de laïcité. En l’exercice de leurs fonctions, qu’elles soient ou non au contact du public, elles ne doivent pas manifester leurs convictions, par leur comportement ou leur tenue, qu’elles soient religieuses, philosophiques ou politiques.