Ingénieur-e en synthèse chimique H/F

L'offre en un coup d'oeil

Réservé uniquement aux agents du service public (fonctionnaires et CDI). Cette offre est ouverte aux personnes disposant d’un titre leur reconnaissant la qualité de travailleur handicapé ou travailleuse handicapée.

L'unité

Chimie et Modélisation pour la Biologie du Cancer

Type de Contrat

Mobilité Interne (NOEMI)

Les Missions

Mettre en œuvre et exploiter des outils de chémo-informatique pour les projets scientifiques issus de criblage de la chimiothèque du laboratoire afin d'accélérer et de rationaliser la découverte de molécules bioactives, principalement au sein de la plateforme Chimiothèque mais aussi en appui aux équipes de l'unité « Chimie et Modélisation pour la Biologie du Cancer ».

L'Activité

1. Modélisation moléculaire
   • Effectuer des docking et criblages virtuels : aspect structural des biomacromolécules et des petits ligands, prédiction de complexes macromolécule(s)/ligand par IA génératives en absence de données structurales (AF, Boltz, Chai, etc).
   • Participer au développement de méthodes de criblage virtuel des molécules de la chimiothèque et pour leur optimisation dépendant de la cible (« fragment-growing ») ou dépendant des propriétés moléculaires.
2. Exploitation des données de la recherche
   • Analyser des données par des méthodes statistiques : SAR, QSAR, QSPR, calcul de descripteurs, analyse de diversité, recherche d'analogues, élaboration de bibliothèques virtuelles pour accélérer et rationaliser la découverte de molécules.
   • Mettre en œuvre des modèles d'apprentissage automatique (Machine Learning) et de grands modèles de langage (LLM) pour la prédiction des propriétés moléculaires, la sélection de nouveaux analogues et la proposition de voies de synthèse/rétro-synthèse.
   • Participer à la veille scientifique sur les nouvelles méthodes et outils en chémoinformatique et intelligence artificielle (IA).
3. Chimiothèque
   • Participer à la gestion et à l'amélioration de la base de données de la chimiothèque (structure, informations chimiques, données biologiques associées).
   • Maintenir et améliorer l'interface web de la chimiothèque, notamment par une meilleure inter-connectivité avec les bases de données nationales et internationales.
   • Participer aux activités de valorisation de la chimiothèque locale et nationale (via l'infrastructure de recherche ChemBioFrance).
4. Activités secondaires
   • Apporter un soutien à la gestion des ressources informatiques communes de la plateforme et de l'unité.

Compétences

Savoirs

• Connaissances générales en chimie organique.
• Connaissances en chimie médicinale (atout : conception de molécules bioactives, relation structure-activité, optimisation de composés).
• Connaissances générales en informatique : Administration système (Linux), Langages de programmation (Bash, Python et/ou R), Langages de requête de type SQL, HTML, PHP.
• Anglais écrit, oral : Niveau B1 (cadre européen commun de référence pour les langues).

Savoir-faire

• Maîtrise des outils et techniques de criblage virtuel (docking, pharmacomodulation) et de modélisation QSAR/QSPR.
• Analyser des données, exploiter des bases de données.
• Rédiger des documentations techniques.

Savoir-être

• Faire preuve d'autonomie.
• Faire preuve de rigueur et de précision.
• Organiser son travail selon les priorités et les objectifs.
• Capacité à communiquer dans un environnement interdisciplinaire.

Votre Environnement de Travail

L'unité Chimie et Modélisation pour la Biologie du Cancer (UMR9187/U1196), située au centre de recherche de l'Institut Curie à Orsay, est une structure interdisciplinaire dédiée à la conception et à la synthèse de sondes moléculaires et de candidats-médicaments anticancéreux, ainsi qu'à l'étude de leurs mécanismes d'action. Elle réunit 50 personnes et s'appuie sur :

• 3 équipes de recherche fondamentale.
• 2 pôles transversaux (modélisation et biologie).
• La plateforme "Chimiothèque", l’une des plus importantes de France, avec près de 13 000 composés issus de 70 ans de recherche.

Le poste s'inscrit au sein de la plateforme "Chimiothèque" et du pôle modélisation de l'unité. L'ingénieur exerce ses fonctions sous la responsabilité de la direction de la plateforme « Chimiothèque » (IR CNRS) et collabore avec :

• Les membres de la plateforme et les 3 équipes de l'unité.
• Les partenaires nationaux (IR ChemBioFrance) et internationaux.

Programme de formation interne :

• Initiation au machine learning et aux modèles LLM (Large Language Models).
• Accompagnement personnalisé en interne sur les outils et méthodes de modélisation, avec accès aux formations CNRS disponibles.

L'ingénieur bénéficiera également de l'écosystème collaboratif de l'infrastructure de recherche ChemBioFrance, et plus particulièrement du pilier ChémoInformatique.

Rémunération et avantages

Congés et RTT annuels : 44 jours.

Pratique et indemnisation du TT : prise en charge à 75 % du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300 €.