Ingénieur-e de recherche plateforme - Bio-impression 3D et imagerie confocale pour l’étude des [...]

Overview

INRAE est un établissement public de recherche regroupant une communauté de travail et menant des activités dans les domaines de l’agriculture, l’alimentation et l’environnement. L’unité concernée est la plateforme Micalis-PIAM, spécialisée dans l’étude des interactions spatiales dans les aliments fermentés solides et le développement d’approches expérimentales et quantitatives pour décrire, mesurer et modéliser les interactions entre microorganismes et matrices alimentaires hétérogènes. Le poste s’inscrit dans le cadre du projet Grand Défi Ferments du Futur, piloté par INRAE et consacré à la fermentation et à la biopréservation.

Responsibilities

• Participer au choix final, à l’installation, à la qualification et à la mise en service du bio-imprimeur 3D.
• Développer des protocoles de bio-impression de communautés microbiennes vivantes dans des matrices modèles et alimentaires.
• Adapter les paramètres d’impression aux contraintes biologiques des microorganismes, aux propriétés rhéologiques des matrices et aux objectifs scientifiques.
• Concevoir des approches de spatialisation contrôlée de microorganismes pour étudier les interactions entre souches, espèces ou consortia microbiens.
• Assurer l’exploitation, la maintenance de premier niveau, le suivi qualité et l’évolution méthodologique du microscope confocal.
• Développer des protocoles d’imagerie confocale 3D et 4D pour suivre l’organisation et la dynamique des communautés microbiennes dans des matrices hétérogènes.
• Mettre en place des méthodes d’analyse d’images pour quantifier la distribution spatiale, la croissance et les interactions entre populations microbiennes.
• Contribuer à l’intégration des données issues de la bio-impression, de l’imagerie et de la microfermentation en collaboration avec l’ingénieur-e d’études.
• Accompagner les utilisateurs académiques et partenaires dans la définition de leurs besoins expérimentaux, la conception des protocoles et l’interprétation des résultats.
• Assurer une veille scientifique et technologique dans les domaines concernés et rédiger les modes opératoires et documents qualité.
• Former les utilisateurs et contribuer à la valorisation scientifique et technologique des développements.
• Participer à l’animation scientifique et technologique du plateau PIAM et du réseau Ferments du Futur.

Qualifications et compétences requises

• Formations recommandées : Doctorat ou diplôme d’ingénieur en microbiologie, biotechnologies, bio-ingénierie, biophysique, sciences des aliments, imagerie biologique, bio-impression, ingénierie des matrices ou discipline apparentée.
• Connaissances souhaitées : Microbiologie expérimentale, physiologie microbienne, biofilms et communautés microbiennes, microbiologie des aliments fermentés, interactions microorganismes-matrices, matrices biologiques et polymériques, bio-impression 3D, imagerie confocale et fluorescence, analyse d’images 2D/3D/4D, rhéologie des matrices, notions de modélisation et de qualité et sécurité en laboratoire, anglais scientifique écrit et oral.
• Expérience appréciée : Développement méthodologique en plateforme technologique, microbiologie expérimentale et manipulation de microorganismes vivants, imagerie 3D ou 4D, analyse d’images (ImageJ/Fiji, Imaris, AIVIA), programmation (Python), bio-impression, microfabrication et travail en mode plateforme.
• Aptitudes : Développement technologique, rigueur expérimentale, autonomie dans des projets techniques, travail en interface entre biologie, instrumentation et analyse, sens du service et de l’accompagnement des utilisateurs, organisation et suivi de projets multiples, formalisation de protocoles et documents qualité, bonnes capacités de communication en français et en anglais.

Conditions et cadre

Lieu: centre INRAE Île-de-France, Jouy-en-Josas – Antony, avec activités au plateau PIAM et sur les plateformes associées. L’unité Micalis est une zone à régime restrictif et les recrutements nécessitent une autorisation préalable du ministère.

Qualité de vie et avantages

• Jusqu’à 30 jours de congés + 15 RTT par an (temps plein).
• Soutien à la parentalité et autres prestations sociales et sportives (intégration des dispositifs de formation et d’accompagnement).
• Restauration collective et chèques vacances, événements culturels et activités sportives.