Ingénieur.e de Recherche en analyses génomiques de la diversité de plantes médicinales réunionnaises

Votre mission principale sera de prendre en charge les analyses génétiques et génomiques des données du projet Qualitiz et leur valorisation.

Dans ce cadre, vos activités seront les suivantes :

• Etudier la diversité génétique des populations naturelles des espèces ciblées après génotypage par séquençage (méthode RADseq ou suite à un enrichissement par capture)
• Mener des analyses phylogénétiques, la clarification botanique de certains taxons, et l'étude de l'histoire démographique des espèces
• Pour 3 espèces, rechercher les facteurs génétiques et environnementaux contrôlant la biosynthèse de molécules bioactives ciblées
• Réaliser l'analyse génomique de familles de gènes impliquées dans la biosynthèse de biomolécules chez deux plantes médicinales, Coffea mauritiana et Psiadia dentata (génome disponible ou en cours de séquençage)
• Participer à la collecte des échantillons de feuilles en milieu naturel (forêts réunionnaises) en accompagnant l'ingénieur en charge de la constitution de l'échantillothèque végétale nécessaire au projet
• Rédiger des articles scientifiques à l'issue des analyses
• Participer au transfert des connaissances auprès des acteurs de la filière 'plantes médicinales' de La Réunion

Vous avez développé les compétences suivantes :

• Maîtrise des approches de génétique/génomique des populations
• Connaissances en biostatistiques et génétique d'association pour tester les effets environnementaux
• Maîtrise des outils bioinformatiques et de langages de programmation (Python, R, …)
• Capacité rédactionnelle et communication en anglais

Vous faites preuve des qualités humaines suivantes :

• Rigueur
• Organisation
• Autonomie
• Aisance relationnelle
• Sens des responsabilités
• Esprit d'initiative

Vous possédez un diplôme Doctorat (niveau 8).

Une première expérience professionnelle dans le domaine est souhaitable.