Ingénieur(e) d'études en biologie moléculaire (H/F)

Offre n° 206GZMD Ingénieur(e) d'études en biologie moléculaire (H/F)

Marseille Medical Genetics UMR 1251 est une unité mixte INSERM dirigée par le Dr Frédérique MAGDINIER relevant une triple mission : déchiffrer les mécanismes impliqués dans les maladies génétiques, développer de nouveaux outils diagnostiques et des stratégies thérapeutiques et améliorer la qualité de vie des patients atteints de ces maladies rares. Dirigée par Anne BARLIER, l'équipe MoPED (Mechanisms of Paracrine and Endocrine Disorders) utilise les principes de la biologie du développement, de la biologie moléculaire et de la biologie des cellules souches pour élaborer des approches diagnostiques et thérapeutiques créatives pour résoudre les problèmes cliniques liés aux maladies du système nerveux et endocrinien. En lien avec le CRMR HYPO dirigé par Thierry BRUE, les services de neurochirurgies et endocrinologies adultes et pédiatriques, et le laboratoire de biologie moléculaire GEnOPé référent dans les maladies héréditaires du système endocrine, nous cherchons à identifier les facteurs clés impliqués dans les mécanismes de différenciation et de prolifération des cellules neuroendocrines (des facteurs de transcription aux récepteurs), afin 1) d'améliorer la compréhension des mécanismes physiopathologiques et de leurs anomalies responsables de déficits hormonaux et de syndromes d'hypersécrétion et de prolifération ; 2) d'améliorer les stratégies de diagnostics moléculaires dans un objectif de médecine personnalisée ; 3) d'identifier de nouvelles stratégies thérapeutiques.

Missions

Nous recherchons un/une ingénieur/e enthousiaste et motivé/e pour mettre en place et conduire des techniques de biologie moléculaire et du développement dans le cadre de projets de recherche en oncogénétique constitutionnelle et somatique des tumeurs hypophysaires.

Activités principales

• Choisir, développer et adapter les protocoles de préparation et d'analyse des échantillons biologiques.
• Conduire, en adaptant les conditions expérimentales, un ensemble de techniques de séquençage NGS sur ADN et ARN depuis l'échantillon primaire jusqu'au séquençage.
• Réaliser les analyses bioinformatiques secondaires en utilisant les logiciels métiers.
• Exploiter et présenter les résultats des analyses, en garantir le suivi et la qualité.
• Rédiger des rapports d'expériences ou d'études, des notes techniques.
• Gérer et organiser les moyens techniques dans le cadre d'un projet scientifique.
• Assurer l'application des principes et des règles d'hygiène et de sécurité.
• Assurer une veille scientifique et technologique dans son domaine d'activité.
• Participer à la diffusion et à la valorisation des résultats sous forme de présentations orales ou de publications.

Conditions particulières d'exercice

Pour remplir ses missions, l'agent travaillera en étroite collaboration avec le membre de l'équipe MoPED du MMG et du laboratoire de biologie moléculaire GEnOPé du Pr Anne BARLIER à l'APHM. Il utilisera principalement les équipements de séquençage et bioinformatiques de la plateforme de Médecine Génomique et Moléculaire de Marseille au sein du Biogénopôle à l'APHM. L'agent travaillera sous la direction des responsables médicaux hospitalo-universitaires du service, en relation étroite avec tous les personnels non médicaux du service ainsi que les fournisseurs.

Connaissances

• Biologie (connaissance approfondie)
• Réglementation en matière d'hygiène et de sécurité
• Cadre légal et déontologique
• Informatique appliquée

Savoir faire

• Mettre en œuvre des techniques de biologie
• Utiliser les logiciels spécifiques à l'activité
• Adapter les pipelines d'analyses
• Rédiger des documents scientifiques
• Gérer les relations avec des interlocuteurs

Savoir être

• Capacité de raisonnement analytique
• Sens de l'organisation

Diplôme

Master (et/ou Doctorat) en biologie moléculaire avec une expérience d'analyse de données NGS OU en bioinformatique avec une expérience en techniques laboratoire.

Type de contrat

CDD – 12 mois. Durée du travail 39 h, 10/semaines. Travail en journée.

Salaire

• Indemnité transports
• brut

Expérience

• Débutant accepté

Compétences

• Analyser, exploiter, structurer des données
• Déterminer et développer les méthodes de recherche, de recueil et d'analyse de données
• Relever, contrôler, ajuster des mesures et dosages
• Réaliser et vérifier des calculs de mathématiques généraux ou appliqués
• Anglais Cette langue est indispensable

Savoir‑être professionnel

• Organiser son travail selon les priorités et les objectifs

Informations complémentaires

• Secteur d'activité : Enseignement supérieur