Ingénieur.e bioinformaticien.ne en analyses transcriptomiques et modélisation

Ingénieur.e bioinformaticien.ne en analyses transcriptomiques et modélisation

Date de prise de poste : 1 août 2026

scRNA‑seq, trajectoire cellulaire, modélisation GRN, bio‑informatique

Nous recherchons un.e ingénieur.e bio‑informatique pour rejoindre notre consortium CellPath. Un financement de 18 mois est disponible dans l’équipe Jarriault (IGBMC, Strasbourg) en lien avec l’équipe Heinrich (SBRI, Lyon).

Notre consortium travaille sur la plasticité cellulaire et la capacité de cellules différenciées à changer d’identité, un phénomène appelé reprogrammation directe ou transdifférenciation. Nous étudions la trajectoire de transdifférenciation (rectale‑vers‑neurone) observée naturellement chez C. elegans et la comparons à une trajectoire gliale‑vers‑neurone dans un modèle murin afin d’en extraire les mécanismes communs.

Connaissances et compétences mobilisées

• Connaissance des données de génomique et de bio‑analyse
• Connaissance des outils d’analyse et de visualisation des données RNA‑Seq, idéalement DAM‑ID et ATAC‑Seq
• Connaissance des méthodes d’analyse des données single‑cell genomique et des techniques de classification (ACP, K‑means, t‑SNE, PLS…)
• Maîtrise de l’environnement Unix
• Langages bash, R, Python ou Perl
• Connaissances en biologie
• Expérience dans le développement de pipelines d’analyse de données (plus)

Missions

• Transfert, stockage et archivage standardisé des données brutes sur les serveurs des équipes
• Développement d’outils d’analyse et interfaces exploitables par les chercheurs (omics, RNA‑Seq)
• Participation à la bio‑analyse des données omics générées (contrôle qualité, analyse et interprétation, comparaison intermédiaire entre modèles)
• Contribuer à la rédaction des sections spécialisées des articles scientifiques

Qualités requises

• Autonome, rigoureux/se, qualités relationnelles, esprit d’initiative, curiosité, créativité technique
• Maîtrise de l’anglais scientifique

Niveau d’étude : Master, ingénieur en bio‑informatique ou bio‑statistiques, ou docteur avec expérience de recherche

Contact : veuillez adresser votre candidature (CV détaillé, lettre de motivation, références) à

Date limite : 3 juillet 2026

Offre publiée le 19 mai 2026, affichage jusqu'au 31 août 2026