Ingénieur de recherche en spectrométrie de masse structurale appliquée aux anticorps thérapeuti[...]
Missions: L’ingénieur(e) de recherche sera recruté(e) au sein du Centre de Biophysique Moléculaire (CBM, CNRS, Orléans) dans le cadre du projet EPIMAP, mené en collaboration avec la société Agro-Bio et coordonné par Dr. Guillaume Gabant. Sa mission principale sera de développer, optimiser et mettre en œuvre une méthodologie innovante de cartographie d’épitopes à haute résolution reposant sur la combinaison de la spectrométrie de masse structurale couplée à l’échange hydrogène–deutérium (HDX-MS) et au pontage chimique covalent (XL-MS), afin de caractériser les interactions antigène–anticorps impliquées dans le développement d’anticorps thérapeutiques. L’ingénieur(e) contribuera également à l’exploitation, à l’interprétation et à la valorisation des données générées dans le cadre du projet EPIMAP.
Activités
- Prendre en main l’automate de préparation d’échantillons dédié aux expériences d’échange hydrogène–deutérium et assurer son fonctionnement.
- Développer, optimiser et mettre en œuvre les protocoles expérimentaux HDX-MS et XL-MS dans le cadre du projet EPIMAP.
- Réaliser les expériences de cartographie d’épitopes sur des systèmes modèles et sur des complexes antigène–anticorps d’intérêt thérapeutique.
- Effectuer les analyses de spectrométrie de masse en modes bottom-up et top-down sur le spectromètre dédié à la biologie structurale.
- Assurer le traitement, l’analyse et l’interprétation des données de spectrométrie de masse à l’aide des logiciels spécialisés.
- Participer à l’intégration des résultats obtenus par HDX-MS, XL-MS et RMN pour la caractérisation des interfaces d’interaction biomoléculaire.
- Contribuer au suivi scientifique du projet et aux échanges avec le partenaire industriel.
- Participer à la rédaction de rapports techniques et scientifiques, de publications et de communications.
- Participer à la formation et au transfert de compétences auprès des utilisateurs et personnels impliqués dans les approches développées.
- Présenter les résultats obtenus lors de réunions de projet, séminaires et congrès scientifiques.
- Assurer une veille scientifique et technologique dans les domaines de la spectrométrie de masse structurale et de la cartographie d’épitopes.
Contexte de travail
Le Centre de Biophysique Moléculaire (CBM) est une unité propre du CNRS d'environ 160 personnes qui développe des recherches à l'interface de la Chimie, de la Biologie et de la Physique. L’ingénieur(e) intégrera la plateforme MO²VING et sera sous la responsabilité hiérarchique du responsable de la plateforme. Il/elle interagira avec les membres de la plateforme puis avec les équipes de recherche du laboratoire et les partenaires extérieurs.
Temps de travail : 38h30 hebdomadaire, congés annuels 44 jours par an, accès à un restaurant administratif.
Profil recherché
Compétences en formation et expérience
- Doctorat (PhD) en chimie analytique, biochimie, biophysique, biologie structurale ou discipline connexe.
- Expérience en spectrométrie de masse appliquée à l’analyse de biomolécules.
- Une expérience en spectrométrie de masse structurale (HDX-MS, XL-MS, top-down MS) sera particulièrement appréciée.
Compétences scientifiques et techniques
- Connaissances en spectrométrie de masse et en analyse des protéines.
- Connaissance des principes de chromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse (LC-MS).
- Connaissances en biochimie et biologie structurale des protéines.
- Expérience dans la préparation et la manipulation d’échantillons biologiques.
- Connaissances des interactions protéine–protéine et des approches de caractérisation structurale.
- Une connaissance des approches d’échange hydrogène–deutérium (HDX-MS), de pontage chimique covalent (XL-MS) ou de fragmentation par capture d’électrons (ECD) constituera un atout.
Savoir-faire opérationnels
- Concevoir, optimiser et mettre en œuvre des protocoles expérimentaux.
- Réaliser des analyses de spectrométrie de masse et interpréter les résultats obtenus.
- Exploiter et traiter des jeux de données complexes.
- Assurer la traçabilité des expériences et la gestion des données scientifiques.
- Rédiger des rapports scientifiques et techniques.
- Présenter des résultats scientifiques à l’oral et à l’écrit.
Logiciels et outils
- Maîtrise des outils bureautiques courants.
- Expérience des logiciels de traitement de données de spectrométrie de masse.
- Une connaissance des logiciels dédiés au HDX-MS et/ou XL-MS (DynamX, HDExaminer ou équivalents) sera appréciée.
Compétences linguistiques
- Maîtrise de l’anglais scientifique écrit et oral (lecture d’articles scientifiques, rédaction de rapports et publications, présentations lors de congrès internationaux et interactions avec les experts applicatifs des fabricants d’instrumentation de spectrométrie de masse).
Compétences personnelles
- Autonomie, rigueur et sens de l’organisation.
- Capacité à travailler en équipe dans un environnement pluridisciplinaire.
- Aptitude à interagir avec des partenaires académiques et industriels.
- Curiosité scientifique, esprit d’initiative et capacité d’adaptation.
Contraintes et risques
- Activité expérimentale en laboratoire de biologie structurale et de spectrométrie de masse.
- Utilisation d’instrumentations scientifiques de haute technologie et manipulation de réactifs chimiques dans le respect des règles de sécurité.
- Interactions régulières avec le partenaire industriel du projet.
- Déplacements ponctuels pour réunions de projet, formations ou congrès scientifiques.