Ingénieur de recherche en bioinformatique (H/F)

Missions: La personne recrutée aura pour mission de développer des stratégies de modélisation mixtes basées sur des modèles basés-agents, l’optimisation multi-objectifs et l’apprentissage machine pour modéliser la physiopathologie tissulaire.

Activités principales: i) Analyser les données issues de travaux de recherche dans différents domaines de la modélisation des phénomènes biologiques pour être en capacité de traduire en modèle informatique des processus biologiques et identifier dans la littérature scientifique les paramètres pouvant être utilisés. ii) Développer de nouveaux modèles informatiques basés‑agents pour modéliser les premières étapes de l’inflammation, réaliser la calibration en utilisant des données biologiques de l’équipe et de la littérature en mettant en œuvre des techniques d’optimisation multi‑objectifs, et mettre en place des modèles d’apprentissage machine et d’explicabilité pour faire l’analyse de sensibilité des modèles. iii) Diffuser et valoriser les résultats et réalisations technologiques sous forme de rapports, brevets, publications et présentations orales. iv) Assurer et organiser la veille scientifique et technologique dans son domaine d'activité.

Activités associées: i) Savoir synthétiser ses résultats de recherche et le présenter à ses collègues. ii) Savoir mettre en forme et synthétiser ses résultats dans le but de les diffuser (grand public, journaux scientifiques, congrès, nationaux et internationaux). iii) Garantir la qualité et la pertinence des outils d’analyse et des résultats. iv) Coordination et planification des différentes phases d'un projet de recherche, participation à l'encadrement de stagiaires et à l'accompagnement méthodologique des différents projets de l’équipe.

Contexte de travail: Le contexte global du projet s'inscrit dans le projet ANR HAPI‑AGING sur la modélisation de l'inflammation tissulaire durant le vieillissement.

Profil recherché

• Maitrise des langages de programmation R, python, C++
• Maitrise de la modélisation basée‑agents
• Maitrise des méthodes d’apprentissage machine et d’explicabilité
• Connaissance des règles d’hygiène et de sécurité
• Excellente communication, rédaction, transmission de savoir‑faire technique, rigueur, organisation et autonomie
• Anglais: compréhension orale (niveau I), compréhension écrite (niveau II).

Contraintes et risques

La personne peut être amenée à se déplacer dans plusieurs instituts ou laboratoires, tels que les sites RESTORE et IRIT (Campus Oncopole, Université de Toulouse campus Rangueil, Université Toulouse Capitole) pour différentes réunions, assister à des formations, acquérir de nouvelles techniques et compétences.