Ingénieur de recherche en Bio-informatique - H/F

Date De Prise De Fonction 01/09/2026

L’Inserm est le seul organisme public français entièrement dédié à la recherche biologique, médicale et en santé des populations. Il dispose de laboratoires de recherche sur l’ensemble du territoire, regroupés en 12 Délégations Régionales. Notre institut réunit 15 000 chercheurs, ingénieurs, techniciens et personnels administratifs, avec un objectif commun : améliorer la santé de tous par le progrès des connaissances sur le vivant et sur les maladies, l’innovation dans les traitements et la recherche en santé publique.

Rejoindre l’Inserm, c’est intégrer un institut engagé pour la parité et l’égalité professionnelle, la diversité et l’accompagnement de ses agents en situation de handicap, dès le recrutement et tout au long de la carrière. Afin de préserver le bien‑être au travail, l’Inserm mène une politique active en matière de conditions de travail, reposant notamment sur un juste équilibre entre vie personnelle et vie professionnelle.

Le Poste

Laboratoire de Recherche Vasculaire Translationnelle - U1148Situé au GH BICHAT CLAUDE BERNARD (Paris 18)

Mission Principale

Nous recrutons un·e ingénieur·e de recherche pour rejoindre un projet de rupture visant à améliorer le diagnostic et le traitement de l’ischémie mésentérique aiguë (IMA). Le projet consiste à combiner plusieurs approches de recherche autour de deux axes majeurs :

• Développement de biomarqueurs diagnostiques pour l’ischémie mésentérique
• Exploitation d’une biobanque de sang humain
• Validation de données métabolomiques existantes et acquisition de nouvelles données protéomiques
• Analyses intégrées et évaluation de leur valeur pronostique et thérapeutique
• Développement de pipelines bioinformatiques pour intégrer des données multi‑omiques (protéomique, métabolomique)
• Interaction avec nos collaborateurs pour développer les outils de machine learning et comparer différents modèles (régression logistique, Random Forest, SVM, réseaux de neurones)
• Identification et évaluation de nouvelles cibles thérapeutiques
• Étude des mécanismes de la thrombo‑inflammation dans un modèle murin d’ischémie‑réperfusion mésentérique
• Analyse du rôle du microbiote intestinal et des traitements antibiotiques
• Profilage métabolique du microbiote par LC‑MS et intégration des données obtenues

Activités Principales

• Participer aux analyses computationnelles et à l’intégration de données multi‑échelles (protéomique, métabolomique, microbiome)
• Développer des pipelines bioinformatiques pour la fusion des données multi‑omiques
• Réaliser des analyses statistiques avancées et des modèles de machine learning pour optimiser la précision diagnostique et la traduction en pratique clinique
• Contribuer à l’analyse des données sur le microbiote et leur interprétation physiopathologique
• Collaborer avec les partenaires expérimentaux pour valider les résultats in silico et guider les expériences fonctionnelles

Profil Recherché

• Etablir une documentation claire et reproductible des analyses
• Participer aux réunions d’équipe
• Participer à la rédaction de compte‑rendu et d’article scientifique
• Traiter et analyser les données, mettre en forme les résultats pour présentations
• Rédiger des rapports d’expériences ou d’études, des protocoles et notes techniques
• Former des personnels aux méthodologies associées au projet

Connaissances

• Modélisation statistique et/ou apprentissage machine
• Analyse de données métabolomiques et protéomiques
• Base de données biologiques (Ensembl, NCBI, etc.)

Savoir‑faire

• Maîtrise de Python et/ou R pour analyse statistique et intégration multi‑omique
• Aisance à travailler dans un environnement collaboratif multidisciplinaire et excellente capacité de communication scientifique
• Maîtrise de l’anglais écrit et parlé

Aptitudes

• Bon relationnel
• Travail d’équipe
• Autonomie
• Rigueur

Expérience(s) Souhaité(s)

• Programmation scientifique
• Analyse et traitement de données
• Développement et utilisation de pipelines bioinformatiques
• Analyse statistique et visualisation de données
• Capacité à travailler en équipe multidisciplinaire et vulgariser des résultats complexes

Niveau De Diplôme Et Formation(s)

• Doctorat Bio‑informatique

Date De Prise De Fonction

01/09/2026

Durée

12 mois renouvelable

Temps De Travail

Temps plein, 38 h 30 hebdomadaires. 32 congés annuels et 12 RTT par année civile.

Rémunération

 € brut mensuel, en fonction de l’expérience professionnelle, sur des postes de niveau équivalent.