Ingénieur de Recherche Biologiste en Traitement de Données H/F

Description du Poste

Le candidat (H/F) aura pour mission principale, sous la responsabilité d'un chercheur d'Edytem (Yves PERRETTE), de réaliser le traitement des données de séquençage 16S pour du métabarcoding obtenues dans le cadre du projet Biokarst financé par l'agence de l'eau Rhône Méditerranée Corse.

Plus spécifiquement, le poste implique :

• Réaliser les traitements bioinformatiques.
• Analyser et présenter les résultats aux membres du projet Biokarst.
• Diffuser et valoriser les données sous forme de rapports techniques et de publications scientifiques.

Votre Profil – Compétences – Savoirs généraux

Connaissances et savoirs :

• Microbiomes associés au milieu souterrain karstique.
• Méthodologies de bioinformatique pour le traitement des données issues de séquençage 16S pour du métabarcoding.
• Outils informatiques (traitement de texte, tableur, R).
• Langue anglaise : B1 à B2 selon le cadre européen commun de référence pour les langues.

Savoir‑faire opérationnels

• Interagir avec les biologistes du laboratoire.
• Interagir avec des partenaires non académiques.
• Assurer une veille scientifique.
• Travailler avec méthode et rigueur.
• Transmettre des connaissances.
• Garantir la qualité et la pertinence des outils d’analyse et des résultats.
• Appliquer les règles d'hygiène et de sécurité.

Environnement de travail

Vous serez encadré par Yves PERRETTE (Edytem) et Florian MERMILLOD-BLONDIN, chercheur au Laboratoire d’Écologie des Hydrosystèmes Naturels et Anthropisés de Lyon. Le poste se déroule sur deux sites : à EDYTEM (Le Bourget-du-Lac) et au LEHNA (Lyon).

Contraintes et risques

Aucun risque particulier identifiés.

Rémunération et avantages

Rémunération : entre 3 143 € et 4 541,08 € bruts mensuels, selon l’expérience.

Congés et RTT annuels : 44 jours.

Pratique et indemnisation du TT : prise en charge à 75 % du coût et un forfait mobilité durable jusqu’à 300 €.