Ingénieur d'études biologisite en traitement de données (Génomique des populations des éléments t (H/F)

Missions: Dans le cadre d’un projet ANR piloté par M. Boulesteix visant à déterminer la contribution des éléments transposables à l’adaptation du moustique tigre Aedes albopictus aux environnements tempérés, la personne recrutée sera en charge de l'analyse de données de génotypage d'insertions d'éléments transposables obtenues à partir de populations d'origines géographiques variées. Elle devra comparer les résultats issus de différentes méthodes de génotypage et réaliser des analyses de génomique des populations de type scan génomique de différenciation.

Activités:

• Contrôle qualité des données de génotypage issues de différents pipelines
• Comparaison des données de génotypage issus de différents pipelines
• Analyses de génomique des populations de type scan génomique (BayPass, OutFlank)
• Rédaction de rapports d'analyses

Contexte de travail:

La personne recrutée rejoindra l'équipe Génétique et Evolution des Interactions (GEI) au sein du laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive (LBBE) à Lyon ( Le LBBE est un grand laboratoire (approx. 200 personnes) dédié à l'étude de l'écologie et de l'évolution et reconnu pour son expertise en bioinformatique. Il accueille en son sein le cluster de calcul du pôle régional de bioinformatique. Les membres de l'équipe GEI s'intéressent au thème du conflit et de la coopération entre les composantes multiples des organismes, des gènes aux bactéries symbiotiques, virus et éléments transposables.

Nos petits +:

• Un environnement de travail stimulant au contact de personnels de la recherche
• Un accompagnement professionnel avec des formations internes au laboratoire
• Une possibilité de télétravailler
• Un restaurant d'entreprise qui permet de déjeuner à un prix intéressant.
• Le remboursement partiel des titres de transport (75%)

forfait mobilité durable pouvant aller jusqu'à 300€/an

• Un site accessible en transport en commun (Tram T1 + T4 + bus)
• 44 jours de congés / RTT par an
• Contrat de protection sociale complémentaire

Conditions particulières d'exercice

Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde: 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers) , en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

Profil recherché

Competences:

• Compétences en bioinformatique (R, Bash, utilisation d'un cluster…)
• Connaissances en génétique / génomique des populations
• Rigueur dans le suivi des analyses
• Clarté dans la transmission des résultats (rapports techniques et communication orale)
• Capacité à identifier les problèmes techniques ET à proposer des solutions le cas échéant
• Anglais niveau B1 (CECRL) minimum

Contraintes et risques:

Présentation de Cnrs

Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieur et de la Recherche. Créé en 1939 et dirigé par des scientifiques, il a pour mission de faire progresser la connaissance et être utile à la société dans le respect des règles d’éthique, de déontologie et d’intégrité scientifique.