Gestionnaire de données biomédicales - 50% RHU envisage & 50% Pole Cardio Thoracique - H/F
Description
Le CHU de Bordeaux recrute un(e) Gestionnaire de données biomédicales (Data-manager) au sein du Centre d'Investigation Clinique (CIC) Cardiovasculaire , sur le site de l'Hôpital Haut-Lévêque.
Le poste est réparti entre deux activités, représentant chacune 50 % du temps de travail (ETP).
- Activité dédiée au RHU ENVISAGE
- L'RHU ENVISAGE (ENhanced Valves Interventions and Safe AI Generated End results ) est un projet de recherche hospitalo-universitaire d'envergure internationale soutenu par le Pr Thomas Modine, responsable scientifique et technique, et l'équipe clinique de l'Unité Médico-chirurgicale des Valvulopathies (UMCV).
- La mission du(e) data‑manager consiste à regrouper les données cliniques transmises par les centres partenaires nationaux et internationaux, les intégrer dans l'e‑CRF du projet, et assurer leur contrôle qualité, cohérence et conformité pour garantir leur exploitation statistique.
- Le data‑manager travaille en étroite collaboration avec l’équipe coordinatrice, notamment le biostatisticien et la chargée d’études.
- Il/elle contribue également à la mise en conformité et à la structuration des bases de données de soins sous REDCap, en lien avec les démarches réglementaires en vigueur, afin de favoriser leur sécurisation, pérennisation et réutilisation à des fins de recherche.
- Activité transversale au sein du CIC Cardiovasculaire
- Accompagner les médecins et internes, en collaboration avec le biostatisticien et la chargée d’études du PCT, dans la préparation des bases de données destinées aux analyses statistiques, aux travaux universitaires et aux publications scientifiques.
- Assurer le contrôle qualité, le nettoyage, la structuration et l'extraction des données afin de produire des jeux de données fiables et exploitables.
- Contribuer à la mise en conformité et à la structuration des bases de données de soins sous REDCap, en lien avec les démarches réglementaires en vigueur.
Mission générale
Le(e) gestionnaire de données biomédicales (data‑manager) conçoit, développe, maintient et sécurise les bases de données de recherche, contrôle la qualité, la cohérence et la conformité des données collectées, puis prépare des jeux de données fiables et exploitables en vue des analyses statistiques, des travaux universitaires et des publications scientifiques. Il/elle aide les cliniciens, les internes et travaille avec le biostatisticien dans la préparation, le contrôle qualité et le nettoyage des bases de données pour garantir leur exploitation pour les analyses statistiques et la valorisation scientifique.
Principales activités
- Gestion des données
- Participer à l'élaboration des jeux de données, en s'assurant de leur conformité et de leur adéquation aux besoins des projets.
- Assurer la migration des données des centres partenaires vers l'e‑CRF du RHU ENVISAGE.
- Préparer les jeux de données répondant aux besoins des cliniciens et des analyses statistiques.
- Concevoir et automatiser des contrôles de cohérence et d’intégrité des données.
- Rédiger les requêtes d'extraction des données nécessaires à l'exploitation des données dans le cadre des études et des analyses statistiques.
- Concevoir et gérer des bases de données multi-dimensionnelles.
- Réaliser le screening des patients pour les projets des services et les études de faisabilité.
- Contribuer à la révision, à la mise à jour et à la validation des documents de gestion des données (plan de gestion des données, plan de validation des données) en lien avec la chargée d'études et le biostatisticien du RHU et du PCT.
- Développement informatique
- Développer et valider les e‑CRF sous REDCap pour les besoins du RHU ENVISAGE et des études/bases de données à thématique cardiovasculaire.
- Élaborer des scripts pour la migration et l'automatisation des données issues des centres partenaires du RHU ENVISAGE, de l'entrepôt de données de santé (EDS) ou des bases de données existantes, vers les e‑CRF sous REDCap.
- Accompagner les équipes dans l'utilisation de l'entrepôt de données de santé (EDS).
- Gérer et optimiser les bases de données existantes à visée de recherche, notamment à l'aide du langage Python.
- Veille informatique
- Réaliser une veille technique et réglementaire relative à son domaine d’activité.
- Fournir un support technique aux membres de l’équipe recherche sur les outils de gestion des données et les meilleures pratiques en matière de qualité des données.
- Rédiger des documents techniques relatifs à la gestion des données.
Profil recherché
Aptitudes attendues
- Concevoir, actualiser, optimiser une base de données pertinente à ses activités.
- Développer, programmer, paramétrer et tester des outils métier.
- Élaborer et argumenter des scénarios ou des solutions acceptables à des problèmes relevant de son domaine de compétence.
- Élaborer, rédiger et exploiter des requêtes relatives à son domaine d’activité.
- Identifier et diagnostiquer un dysfonctionnement, une panne, ou l’anomalie d’un système spécifique à son domaine d’activité.
- Programmer dans différents environnements informatiques.
- Rédiger des informations relatives à son domaine d’intervention pour assurer un suivi et une traçabilité.
- Rédiger et mettre en forme des notes, documents et/ou rapports relatifs à son domaine de compétence.
- Travailler en équipe pluridisciplinaire ou en réseau.
- Utiliser les logiciels métier.
Connaissances attendues
- Anglais scientifique.
- Bureautique.
- Droit des données informatiques.
- Éthique et déontologie médicales.
- Gestion de données relatives à son domaine.
- Langage de programmation.
- Logiciel dédié aux bases de données biomédicales.
- Organisation et fonctionnement interne de l’établissement.
- Sécurité informatique, sécurité SI.
- Statistiques.
- Vocabulaire biomédical.