Décrypter les mécanismes précoces d'immunosurveillance des cellules NK contre les cellules prén[...]

Organisation/Company Université Claude Bernard Lyon 1 Research Field Biological sciences » Biology Researcher Profile Recognised Researcher (R2) Leading Researcher (R4) First Stage Researcher (R1) Established Researcher (R3) Application Deadline 10 May 2026 - 22:00 (UTC) Country France Type of Contract Temporary Job Status Full-time Is the job funded through the EU Research Framework Programme? Not funded by a EU programme Is the Job related to staff position within a Research Infrastructure? No

Offer Description

Le cancer du sein demeure la première cause de mortalité par cancer chez la femme. Malgré les progrès récents, les immunothérapies actuelles, principalement centrées sur les lymphocytes T, montrent un bénéfice limité dans ce cancer. Or, des données émergentes suggèrent que les cellules NK jouent un rôle déterminant dans les toutes premières étapes de l’immunosurveillance antitumorale, notamment lors de la transition entre tissu sain, lésion prénéoplasique et tumeur invasive. Cependant, les mécanismes précoces permettant aux cellules NK de détecter et contrôler les cellules prénéoplasiques restent largement méconnus.

Ce projet de thèse vise à caractériser de manière intégrée, dynamique et multimodale les interactions entre les cellules NK et les cellules épithéliales prénéoplasiques dans le cancer du sein, afin d’identifier de nouvelles cibles thérapeutiques permettant soit d’intercepter la progression tumorale, soit de restaurer une immunité NK efficace à des stades avancés.

1. Caractériser la dynamique des cellules NK au cours de la tumorigenèse, en combinant analyses transcriptomiques, cytométrie spectrale, tests fonctionnels et modélisation in vitro/ex vivo.
2. Identifier les interactions ligand/récepteur qui gouvernent l’activation des cellules NK dans les lésions prénéoplasiques, via l’intégration d’analyses spatiales et d’inférences cellulaires, puis valider ces interactions chez la souris et chez l’humain.
3. Démontrer la pertinence biologique des voies d’immunosurveillance identifiées, par validations fonctionnelles in vitro et in vivo, notamment via le blocage ciblé d’interactions clés ou via des modèles murins génétiquement modifiés.

Ce travail mobilise des technologies de pointe disponibles au CRCL (single-cell RNA‑seq, transcriptomique spatiale Xenium, cytométrie spectrale, organoïdes murins, modèles murins transgéniques). Il s’inscrit dans une expertise établie de l’équipe en immunosurveillance dans l’immunité innée.

Retombées attendues : Le projet fournira une cartographie sans précédent des mécanismes précoces d’immunosurveillance NK et devrait permettre l’identification de nouvelles cibles thérapeutiques pour activer ou restaurer les fonctions NK, ouvrant la voie à des stratégies innovantes d’immuno‑interception ou d’immunothérapie dans le cancer du sein.

Début de la thèse : 01/09/2026

Funding category: Contrat doctoral

Concours pour un contrat doctoral

Knowledge

• Strong knowledge of immunology, cancer biology and immunotherapies.

Operational Skills / Technical Expertise

• Cell biology: Cell culture, including 3D culture models; cell isolation from tissues.
• Immunology techniques: ELISA/MSD assays; multiparametric spectral flow cytometry.
• In situ analysis techniques: Immunohistochemistry (IHC) / Immunofluorescence (IF).
• Data analysis: Proficiency with flow cytometry analysis software (FlowJo, SpectroFlo, NovoExpress), image analysis tools (Phenochart, Halo), and statistical/visualization software (GraphPad Prism).
• Ability to draft scientific documents.
• Development of new experimental techniques and writing (new) experimental protocols.

Behavioral Skills / Soft Skills

• Autonomy
• Strong organizational abilities
• Rigor and reliability
• Versatility
• Analytical reasoning skills (analysis, interpretation, presentation of results)
• Ability to develop critical thinking and synthesis
• Literature review to refine research questions or identify new directions (scientific article analysis)
• Active involvement in laboratory life (participation in daily activities)
• Good interpersonal and communication skills