Concours externe CNRS – Ingénieur.e d’étude – Challenges FBI

Concours externe CNRS – Ingénieur.e d’étude – Challenges FBI

Location: LIRMM - Laboratoire d'informatique, de robotique et de microélectronique de Montpellier, Rue Ada, Montpellier, France

France-BioImaging, infrastructure nationale de recherche en biologie et santé dédiée à la bioimagerie, recrute un.e ingénieur.e d’étude pour la gestion des Challenges FBI (compétition de machine learning).

En parallèle de ces missions, 20% du temps de travail sera dédié à des actions locales au sein de LIRMM et à l’Institut de Science des Données de Montpellier (ISDM).

Activités principales

Participation à la conception et pilotage de challenges scientifiques, d’activités de recherches de grande qualité:

• Participer à la définition des thématiques des challenges en lien avec la communauté (chercheurs et ingénieurs des plateformes, laboratoires, développeurs IA)
• Formaliser et organiser les objectifs scientifiques, les spécifications des données et les critères d’évaluation
• Mobiliser la communauté pour la production de données
• Élaborer les protocoles d’acquisition , formuler des requêtes d’études détaillées des données collectées et organisées

Construction du plan et gestion de bases de données FAIR:

• Coordonner la collecte, le contrôle qualité (méthodes et normes appliquées), l’annotation, la standardisation des images et métadonnées
• Structurer les jeux de données en conformité avec les principes FAIR
• Assurer la maintenance et l’évolution des bases de données

Développement et administration des plateformes associées:

• Mettre en place les outils pour l’organisation des challenges (sites web, interfaces de soumission, plateformes d’évaluation)
• Administrer les systèmes d’information liés à la diffusion et à la gestion des données (base de données, API, hébergement)
• Garantir la sécurité, la fiabilité, l’accessibilité des services mis en ligne

Animation et mobilisation de la communauté:

• Solliciter activement les plateformes pour la contribution de données
• Organiser des réunions, sessions d’information ou webinaires
• Promouvoir les challenges: réseaux sociaux, conférences…

Support technique et accompagnement des utilisateurs:

• Répondre aux questions techniques, assurer le support
• Garantir une expérience utilisateur fluide tout au long du challenge: de l’inscription aux résultats

Analyse des résultats et valorisation scientifique:

• Analyser les performances des méthodes, établir des classements, synthèses comparatives
• Participer à la rédaction d’articles scientifiques
• Assurer le dépôt des données et publications

Savoirs:

• Solide culture en gestion et structuration des données scientifiques (datastewardship, bases de données, métadonnées)
• Maîtrise des principes FAIR et de leur implémentation dans un contextescientifique
• Bonnes connaissances théoriques et pratiques en apprentissage profond appliqué àl’analyse d’images
• Bonne compréhension des enjeux spécifiques à l’imagerie en biologie(variabilité, variété, volumétrie, annotation, etc.)

Savoirs faire:

• Maîtrise de Python (numpy, pandas, pytorch/tensorflow, etc.)
• Compétences en gestion de projets collaboratifs (organisation, priorisation,coordination).
• Capacité à vulgariser des notions complexes et à faire le lien entre communautésscientifiques diverses

Savoir-être:

• Autonomie, rigueur, sens de l’initiative
• Excellentes qualités relationnelles , capacités d’écoute et d’animation de communauté
• Appétence pour le travail en équipe dans un environnement pluridisciplinaire
• Sens du service public et engagement dans les actions de mutualisation et de diffusion

Informations générales

Emploi-type: Administratrice ou administrateur de bases de données / Intégrateur d’applications