Concours externe CNRS – Ingénieur.e d’étude – Challenges FBI

Organisation: France-BioImaging

Location: LIRMM - Laboratoire d'informatique, de robotique et de microélectronique de Montpellier, Rue Ada, Montpellier, France

Position Description

France-BioImaging, infrastructure nationale de recherche en biologie et santé dédiée à la bioimagerie, recrute un.e ingénieur.e d’étude pour la gestion des Challenges FBI (compétition de machine learning). Le poste est rattaché au nœud transverse “Image Processing and Data Management” et basé à Montpellier où il sera intégré dans le Laboratoire d’Informatique, de Robotique et de Microélectronique de Montpellier (LIRMM, UMR5506 CNRS/Université de Montpellier). En parallèle de ces missions, 20 % du temps de travail sera dédié à des actions locales au sein de LIRMM et à l’Institut de Science des Données de Montpellier (ISDM).

Responsibilities

• Participer à la définition des thématiques des challenges en lien avec la communauté (chercheurs, ingénieurs, laboratoires, développeurs IA)
• Formaliser et organiser les objectifs scientifiques, les spécifications des données et les critères d’évaluation
• Mobiliser la communauté pour la production de données
• Élaborer les protocoles d’acquisition, formuler des requêtes d’études détaillées des données collectées et organisées
• Coordonner la collecte, le contrôle qualité, l’annotation et la standardisation des images et métadonnées
• Structurer les jeux de données en conformité avec les principes FAIR
• Assurer la maintenance et l’évolution des bases de données
• Mettre en place les outils pour l’organisation des challenges (sites web, interfaces de soumission, plateformes d’évaluation)
• Administrer les systèmes d’information liés à la diffusion et à la gestion des données (base de données, API, hébergement)
• Garantir la sécurité, la fiabilité et l’accessibilité des services mis en ligne
• Solliciter activement les plateformes pour la contribution de données
• Organiser des réunions, sessions d’information ou webinaires
• Promouvoir les challenges via réseaux sociaux, conférences, etc.
• Répondre aux questions techniques, assurer le support
• Garantir une expérience utilisateur fluide tout au long du challenge (inscription aux résultats)
• Analyser les performances des méthodes, établir des classements, synthèses comparatives
• Participer à la rédaction d’articles scientifiques
• Assurer le dépôt des données et publications

Qualifications

Savoirs

• Solide culture en gestion et structuration des données scientifiques (data stewardship, bases de données, métadonnées)
• Maîtrise des principes FAIR et de leur implémentation dans un contexte scientifique
• Bonnes connaissances théoriques et pratiques en apprentissage profond appliqué à l’analyse d’images
• Bonne compréhension des enjeux spécifiques à l’imagerie en biologie (variabilité, variété, volumétrie, annotation, etc.)

Savoirs Faire

• Maîtrise de Python (numpy, pandas, pytorch, tensorflow, etc.)
• Connaissance du développement d’interfaces utilisateurs (Javascript, HTML, frameworks web)
• Compétences en gestion de projets collaboratifs (organisation, priorisation, coordination)
• Capacité à vulgariser des notions complexes et à faire le lien entre communautés scientifiques diverses

Savoir‑être

• Autonomie, rigueur, sens de l’initiative
• Excellentes qualités relationnelles, capacités d’écoute et d’animation de communauté
• Appétence pour le travail en équipe dans un environnement pluridisciplinaire
• Sens du service public et engagement dans les actions de mutualisation et de diffusion

Employment Type

Administratrice ou administrateur de bases de données / Intégrateur d’applications

Location

LIRMM, Montpellier

Application

Pour candidater, consulter le concours n°131 sur