Chef.fe de Projetstructuration de données d'imagerie photonique (H/F)

35H/semaine, Travail en journée, Jamais Zone départementale.

En collaboration avec l'équipe de chercheurs et techniciens des plateformes NIT et INPHIM de l'Institut de Neurosciences de la Timone (INT) à Aix Marseille Université (amU), l'ingénieur-e de recherche mettra en œuvre la structuration, la standardisation et la sécurisation des données d'imagerie photonique produites au sein de l'Institut. Il/elle sera responsable de la mise en place et du maintien des outils FAIR (OMERO, BIDS, eLabFTW) et assurera l'interface technique avec les plateformes régionales et nationales (Datacenter amU, 4Domics, FBI.data).

Activités principales

• Déployer, configurer et maintenir la base OMERO pour les données anatomiques et fonctionnelles.
• Intégrer à la chaîne de traitement les métadonnées selon les standards BIDS/eLabFTW.
• Assurer la traçabilité et la reproductibilité des données dès l'acquisition.
• Collaborer avec les équipes des plateformes pour faciliter l'adoption des outils par les utilisateurs.
• Gérer les transferts et l'archivage des données sur les serveurs locaux de l'INT et nationaux (4Domics, FBI.data).
• Développer des pipelines d'automatisation de traitements liés à l'organisation des données.
• Participer à la formation et au support des utilisateurs des plateformes d'imagerie.
• Contribuer à la documentation et aux bonnes pratiques pour assurer la pérennité du système.