Caractérisation de l'immunité anti-avipoxvirus chez l'Outarde houbara // Characterization of an[...]

Caractérisation de l'immunité anti-avipoxvirus chez l'Outarde houbara // Characterization of anti-avipoxvirus immunity in the Houbara Bustard

Réf ABG- ADUM-74891 Sujet de Thèse

Institut National Polytechnique de Toulouse

Lieu de travail Toulouse cedex - Occitanie - France

Intitulé du sujet Caractérisation de l'immunité anti-avipoxvirus chez l'Outarde houbara // Characterization of anti-avipoxvirus immunity in the Houbara Bustard

Champs scientifiques

• Ecologie, environnement

Mots clés

• variole aviaire, vaccination, conservation, sérologie
• avian pox, vaccination, conservation, serology

Description du sujet

La conservation des espèces menacées repose en partie sur des programmes d'élevage conservatoire et de renforcement des populations sauvages. La captivité expose ces animaux à des risques infectieux spécifiques (densité élevée, contacts interspécifiques, interactions humaines). Les outardes houbara, africaines et asiatiques, font l'objet de tels programmes depuis plus de 30 ans, constituant un modèle pertinent pour étudier les enjeux sanitaires associés à la conservation.

Parmi les agents pathogènes affectant ces populations, les avipoxvirus représentent une menace majeure. Leur circulation est fréquente en élevage, avec une grande diversité de souches appartenant aux clades des fowlpox-like et canarypox-like virus, d'origines variées. Les infections peuvent entraîner des formes cliniques variées, parfois sévères et létales. La prophylaxie repose essentiellement sur la vaccination (utilisant des vaccins canarypox et fowlpox), mais son efficacité reste incertaine en raison de la diversité des virus et du manque d'outils permettant d'évaluer précisément les réponses immunitaires et la protection conférée.

Ce projet de thèse vise à caractériser l'immunité anti-avipoxvirus chez l'outarde houbara afin d'améliorer les stratégies de contrôle. Trois questions principales seront abordées : (i) l'identification de marqueurs génétiques de virulence des avipoxvirus, (ii) le développement d'outils pour évaluer la réponse immunitaire protectrice chez l'hôte, et (iii) l'étude de la protection croisée entre différentes souches virales.

Le programme scientifique s'articule autour de ces trois axes. Le premier consiste à analyser les relations entre génotypes viraux et pathotypes à partir de données d'élevage, incluant le séquençage complet de souches représentatives et l'identification de marqueurs de virulence. Le second axe vise à produire par isolement une banque de virus qui servira ensuite à développer des outils sérologiques, notamment des tests de séroneutralisation. Le troisième axe portera sur l'évaluation de la protection croisée via des essais vaccinaux homologues et hétérologues, combinés à des analyses immunologiques (séroneutralisation, recherche de marqueurs moléculaires tels que cytokines et interféron gamma).

Les résultats attendus incluent la cartographie des déterminants génétiques de virulence, la constitution d'une banque de souches virales, le développement d'outils d'évaluation immunitaire, et une meilleure compréhension des mécanismes de protection croisée. À terme, ces travaux permettront d'optimiser les stratégies vaccinales et de renforcer la gestion sanitaire des élevages d'outardes houbaras, tout en apportant des connaissances transférables à d'autres contextes de conservation et de contrôle des infections par les avipoxvirus.

Début de la thèse : 01/10/2026

Nature du financement

Associations, fondations, programmes privés étrangers

Présentation établissement et labo d'accueil

Institut National Polytechnique de Toulouse

Etablissement délivrant le doctorat

Institut National Polytechnique de Toulouse

Ecole doctorale

458 SEVAB - Sciences Ecologiques, Vétérinaires, Agronomiques et Bioingenieries

Profil du candidat

• Les candidats doivent être titulaires d'un master, idéalement en biologie cellulaire, en microbiologie, en virologie ou dans un domaine équivalent. Une expérience de travail en biologie moléculaire ou en immunologie serait un plus. Des compétences en bio-informatique (alignement et analyse de séquence) et en statistique sont fortement souhaitées.
• Un enthousiasme pour les maladies infectieuses, la santé animale et le travail en équipe et interdisciplinaire est souhaitable.
• Applicants must hold a Master's degree, preferably in cell biology, microbiology, virology or a related field. Experience in molecular biology or immunology would be an asset. Skills in bioinformatics (sequence alignment and analysis) and statistics are strongly desirable.
• A strong interest in infectious diseases, animal health, and collaborative, interdisciplinary work is expected.