Bioinformaticienne / Bioinformaticien en microbiologie & pathologie moléculaire

Bioinformaticienne / Bioinformaticien en microbiologie & pathologie moléculaire

CDD·IE·12 mois (renouvelable). Bac+5 / Master. CHU Dijon, Pôle de biologie, service de microbiologie / service de pathologie moléculaire – Dijon (France).

Date de prise de poste : 1 septembre 2026

Recrutement au CHU de Dijon pour les services de microbiologie-agents transmissibles et pathologie moléculaire. Vous mettrez au point des outils et solutions bioinformatiques permettant d’organiser, de comparer, d’analyser et de diffuser des données biologiques.

Activités et périmètre du poste

• Analyse en génomique comparative, identification d’espèces
• Assemblage, orfing et annotation de données issues de séquençage à haut débit
• Détection de variations constitutionnelles et somatiques à partir de données de séquençage à haut débit
• Développement des logiciels, scripts et interfaces nécessaires à l’exploitation des données biologiques et médicales
• Développement de pipelines d’analyse et de méthodes d’automatisation des analyses
• Paramétrage des outils, logiciels et systèmes du domaine d’activité
• Mise en place de bases de données moléculaires
• Conseil aux décideurs concernant les choix, les projets et les activités du domaine
• Définition des prototypages et jeux d’essai
• Définition et réalisation d’interfaces homme-machine
• Identification de marqueurs génomiques de résistance aux antimicrobiens et de virulence
• Programme de développement des logiciels, incluant pipelines bio-informatique pour données NGS
• Utilisation des outils, plateformes et pipelines d’analyses bioinformatiques existants
• Formation de personnes aux techniques et procédures du domaine
• Participation à la rédaction de publications scientifiques et médicales
• Participation et présentation de travaux dans des congrès scientifiques
• Recensement et analyse des besoins des utilisateurs spécifiques au domaine
• Traitement et analyse de l’information/ données médicales et/ou biologiques : extraction, regroupement, représentation graphique
• Veille scientifique et professionnelle
• Prise en compte des enjeux de développement durable dans le cadre des missions

Profil recherché

• Master en bioinformatique ou diplôme d’école d’ingénieurs (INSA Lyon, ISBS, etc.)
• Formation en biologie ou en biochimie
• Connaissances approfondies en biologie moléculaire

Avantages

• Accès au plan de formation du CHU
• Soutien transport en commun (75 % de l’abonnement)
• Accès aux installations sportives et aux bien‑être