Bioinformaticienne / Bioinformaticien en microbiologie & pathologie moléculaire

Bioinformaticienne / Bioinformaticien en microbiologie & pathologie moléculaire

CDD·IE·12 mois(renouvelable)Bac+5 / MasterCHU Dijon, Pôle de biologie, service de micriobiologie / service de pathologie moléculaire·Dijon (France)

Date de prise de poste : 1 septembre 2026

microbiologie séquençage biologie moléculaire virologie somatique pathologie moléculaire

Le CHU de Dijon recrute un bioinformaticien pour les services de microbiologie-agents transmissibles et pathologie moléculaire. Vous mettrez au point des outils et solutions bioinformatiques permettant d’organiser, de comparer, d’analyser, et de diffuser des données biologiques.

**Activités et périmètre du poste **-Analyse en génomique comparative, identification d’espèces-Assemblage, orfing et annotation de données issues de séquençage à haut-débit-Détection de variations constitutionnelles et somatiques à partir de données de séquençage à haut-débit-Développement des logiciels, scripts et interfaces nécessaires à l’exploitation des données biologiques et médicales-Développement de pipelines d’analyse, de méthodes d’automatisation des analyses-Paramétrage des outils, logiciels, systèmes relevant de son domaine d’activité-Mise en place de bases de données moléculaires-Conseil aux décideurs concernant les choix, les projets, les activités du domaine d’activité-Définition des prototypages et jeux d’essai-Définition et réalisation d’interfaces homme-machine-Identification de marqueurs génomiques de résistance aux antimicrobiens, de virulence …-Développement des progiciels et programmation nécessaires à l’exploitation des données biologiques et médicales incluant le développement de Pipelines d’analyse bio-informatique des données issues du séquençage haut débit (NGS)-Savoir utiliser les outils, plateformes et pipelines d’analyses bioinformatiques déjà en place-Formation de personnes aux techniques et procédures de son domaine, et à leur application-Participation à la rédaction de publications scientifiques et médicales-Participation et présentation de travaux dans des congrès scientifiques-Recensement et analyse des besoins des utilisateurs, spécifiques à son domaine-Traitement et analyse de l’information/données médicale et/ou biologique : extraction, regroupement, représentation graphique-Veille scientifique et professionnelle-Prise en compte des enjeux de développement durable dans le cadre de l’application des missions

**Profil recherché **

Vous avez un master en bioinformatique ou un diplôme d’école d’ingénieurs (INSA Lyon, ISBS…) ?

Vous avez une formation en biologie ou en biochimie ?

Vous disposez de connaissances approfondies en biologie moléculaire ?

Alors n’hésitez plus, postulez !

Rejoindre le CHU, c’est mettre ses compétences en bioinformatique au service direct de la santé humaine. Au sein d’un environnement hospitalo-universitaire dynamique, le bioinformaticien contribue à l’analyse et à l’interprétation de données biologiques ayant un impact concret sur le diagnostic, le suivi et la prise en charge des patients. À l’interface entre microbiologie, pathologie moléculaire, recherche et pratique clinique, il participe au développement et à l’amélioration d’outils innovants répondant aux enjeux actuels de la médecine de précision, des maladies infectieuses et des pathologies génétiques ou oncologiques. Ce poste offre l’opportunité de travailler sur des problématiques médicales variées, au contact d’équipes pluridisciplinaires engagées dans l’amélioration continue des soins au sein d’une équipe dynamique d’une dizaine de bioinformaticiens, data manager et développeurs.

Les petits + :

Accès à l’ensemble du Plan de formation, très fourni (5 millions € par an dédiés à la formation)Accès aux selfs du CHU, possibilité de demander des places de crèche du CHUAccès au CGOS : vacances à prix réduit, tarifs préférentiels sur des spectacles, parc d’attractions, chèque culture, chèques vacances, etc.Prise en charge de 75% de l’abonnement de transport en communAteliers bien-être et salle de sport accessibles gratuitement

Mots-Clés

microbiologie séquençage biologie moléculaire virologie somatique pathologie moléculaire

Description

Le CHU de Dijon recrute un bioinformaticien pour les services de microbiologie-agents transmissibles et pathologie moléculaire. Vous mettrez au point des outils et solutions bioinformatiques permettant d’organiser, de comparer, d’analyser, et de diffuser des données biologiques.

**Activités et périmètre du poste **-Analyse en génomique comparative, identification d’espèces-Assemblage, orfing et annotation de données issues de séquençage à haut-débit-Détection de variations constitutionnelles et somatiques à partir de données de séquençage à haut-débit-Développement des logiciels, scripts et interfaces nécessaires à l’exploitation des données biologiques et médicales-Développement de pipelines d’analyse, de méthodes d’automatisation des analyses-Paramétrage des outils, logiciels, systèmes relevant de son domaine d’activité-Mise en place de bases de données moléculaires-Conseil aux décideurs concernant les choix, les projets, les activités du domaine d’activité-Définition des prototypages et jeux d’essai-Définition et réalisation d’interfaces homme-machine-Identification de marqueurs génomiques de résistance aux antimicrobiens, de virulence …-Développement des progiciels et programmation nécessaires à l’exploitation des données biologiques et médicales incluant le développement de Pipelines d’analyse bio-informatique des données issues du séquençage haut débit (NGS)-Savoir utiliser les outils, plateformes et pipelines d’analyses bioinformatiques déjà en place-Formation de personnes aux techniques et procédures de son domaine, et à leur application-Participation à la rédaction de publications scientifiques et médicales-Participation et présentation de travaux dans des congrès scientifiques-Recensement et analyse des besoins des utilisateurs, spécifiques à son domaine-Traitement et analyse de l’information/données médicale et/ou biologique : extraction, regroupement, représentation graphique-Veille scientifique et professionnelle-Prise en compte des enjeux de développement durable dans le cadre de l’application des missions

**Profil recherché **

Vous avez un master en bioinformatique ou un diplôme d’école d’ingénieurs (INSA Lyon, ISBS…) ?

Vous avez une formation en biologie ou en biochimie ?

Vous disposez de connaissances approfondies en biologie moléculaire ?

Alors n’hésitez plus, postulez !

Rejoindre le CHU, c’est mettre ses compétences en bioinformatique au service direct de la santé humaine. Au sein d’un environnement hospitalo-universitaire dynamique, le bioinformaticien contribue à l’analyse et à l’interprétation de données biologiques ayant un impact concret sur le diagnostic, le suivi et la prise en charge des patients. À l’interface entre microbiologie, pathologie moléculaire, recherche et pratique clinique, il participe au développement et à l’amélioration d’outils innovants répondant aux enjeux actuels de la médecine de précision, des maladies infectieuses et des pathologies génétiques ou oncologiques. Ce poste offre l’opportunité de travailler sur des problématiques médicales variées, au contact d’équipes pluridisciplinaires engagées dans l’amélioration continue des soins au sein d’une équipe dynamique d’une dizaine de bioinformaticiens, data manager et développeurs.

Les petits + :

Accès à l’ensemble du Plan de formation, très fourni (5 millions € par an dédiés à la formation)Accès aux selfs du CHU, possibilité de demander des places de crèche du CHUAccès au CGOS : vacances à prix réduit, tarifs préférentiels sur des spectacles, parc d’attractions, chèque culture, chèques vacances, etc.Prise en charge de 75% de l’abonnement de transport en communAteliers bien-être et salle de sport accessibles gratuitement

Pour plus d’informations sur le poste, merci de contacter :

Pour postuler, rendez vous sur cette page :

Procédure : Candidater via le lien :

Offre publiée le 22 mai 2026, affichage jusqu'au 30 juin 2026

#J-18808-Ljbffr