Post doctorat (H/F) en résolution structurale cryo-TEM d’un polymère conducteur
Description du Poste Les Missions Le post-doctorant / la post-doctorante contribuera à la description structurale à l’échelle moléculaire d’un complexe polymère (PEDOT :PSS) dont la structure reste largement débattue dans la communauté scientifique mondiale. Il s’agira de transférer et adapter les approches, développées en biologie structurale pour la reconstruction de structures cryo-TEM, en chimie. Le projet est financé par le CNRS Chimie. L'Activité L’objectif de ce projet de recherche est d’obtenir un modèle 3D à l’échelle quasi-atomique des fibres de PEDOT:PSS (polymère pi-conjugué, semi-conducteur) présentes en dispersion dans l’eau. Ce complexe de polymères est de référence dans de nombreux domaines de l’énergie (photovoltaïque, thermoélectricité, capteur, etc.), de la bioélectronique ou du biomédical aussi bien au niveau industriel qu’académique. L’approche utilisée pour révéler la structure est la combinaison de (1) la cryo- microscopie électronique à transmission (cryo-TEM) à haute résolution et (2) l’analyse d’images par des logiciels comme RELION ou cryo
SPARC. Cette méthodologie a déjà été largement exploitée en biologie structural mais encore trop peu pour des polymères Notre objectif est donc d’utiliser les mêmes approches pour le PEDOT :PSS. À partir de jeux de données cryo-TEM en haute résolution, il s’agira d’analyser les structures présentes dans les micrographies et de réaliser une sélection des objets selon leur morphologie. Une étape d’optimisation des paramètres de traitement d’images contribuant à l’obtention de classes 2D moyennes sera ensuite nécessaire. Par la suite, il sera possible de vérifier la qualité des classes 2D par des analyses comparatives de diffusion de rayons X. L’objectif final est d’obtenir une reconstruction 3D et d’affiner le modèle structural en prenant en compte les données de diffusion de rayons X (SAXS-WAXS) et la littérature sur la structure du PEDOT :PSS.
Cette méthodologie déjà développée dans notre laboratoi...